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植物清洗液eDNA宏条形码技术:监测稻田节肢动物多样性的创新方法
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月16日 来源:Journal of Integrative Agriculture 4.6
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为解决传统节肢动物调查方法效率低、成本高的问题,研究人员通过eDNA宏条形码技术对水稻田四种样本基质(RPCF、花粉、土壤、水体)进行检测,发现COI引物(mlCOIintF/jgHCO2198R)和RPCF样本可显著提升物种检出率,为农业生态系统评估提供高效工具。
在农业生产中,节肢动物扮演着传粉者、捕食者和害虫等多重角色,其多样性直接影响着生态系统的健康与功能。然而,传统的生物多样性调查方法依赖人工采集和形态学鉴定,不仅耗费大量人力物力,还受限于日益稀缺的分类学专家资源。这种困境在稻田生态系统中尤为突出——广袤的水稻种植区需要更高效、标准化的监测手段。
针对这一挑战,研究人员开展了一项创新性研究,探索利用环境DNA(eDNA)宏条形码技术从植物清洗液(RPCF)等非传统样本中检测节肢动物多样性的可行性。该研究选取了转Bt基因水稻和常规水稻田作为实验场地,通过比较四种不同样本基质(RPCF、水稻花粉、土壤和水体)的检测效果,并测试了多种DNA条形码引物的适用性。
研究采用了eDNA宏条形码技术这一前沿方法,通过采集水稻田的RPCF等样本,使用COI(细胞色素c氧化酶亚基I)、16S rRNA等通用引物进行PCR扩增和高通量测序。样本来自Bt水稻和非Bt水稻的对比试验田,通过α多样性分析和物种组成比较验证方法的可靠性。
样本基质比较揭示RPCF优势
研究发现,从水稻植株清洗液(RPCF)中提取的eDNA可检测到比传统吸虫器采样多15%的节肢动物物种,尤其在抽穗期采集的花粉样本中也显示出丰富的多样性信息。这表明植物表面附着的eDNA能有效反映田间节肢动物群落状况。
COI引物展现最佳检测效能
在测试的多种DNA条形码中,COI基因引物组合mlCOIintF/jgHCO2198R表现出最强的物种鉴别能力,成功鉴定了稻田中绝大多数节肢动物类群,为后续研究提供了标准化的分子检测方案。
Bt水稻生态安全性验证
研究结果显示,转Bt基因水稻田与传统稻田的节肢动物α多样性和类群组成无显著差异,这一发现与传统形态学调查结果一致,从分子层面证实了Bt作物对节肢动物群落的潜在影响可控。
该研究首次系统评估了eDNA宏条形码技术在稻田生态系统监测中的应用价值。通过优化采样策略(RPCF优先)和分子标记选择(COI引物),建立了一套高效、标准化的农业节肢动物监测方案。这不仅解决了传统方法效率低下的问题,还为转基因作物的生态安全评估提供了新工具。特别值得注意的是,植物清洗液这一创新样本来源的发现,突破了土壤/水体等传统eDNA样本的局限,为作物-昆虫互作研究开辟了新途径。研究成果发表于《Journal of Integrative Agriculture》,为智慧农业背景下的生物多样性监测提供了重要技术支撑。
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