基于宏基因组学的高风险口岸环境微生物风险评估与溯源研究：深圳口岸动态监测与四级消毒策略构建

为解决国际旅行复苏背景下跨境传染病输入风险加剧的问题，研究人员采用宏基因组学技术对深圳三个入境口岸126份环境样本进行动态监测。研究发现55类非病毒微生物群落和12种病毒类群，其中26.8%细菌、100%真菌及71.4%原生生物具有潜在致病性，并首次检出鸽圆环病毒和H4N2亚型禽流感病毒。研究构建了基于微生物丰度的四级消毒分区模型（关键/一般/较安全/安全消毒区），为口岸精准防控提供科学依据，填补了环境宏基因组学在跨境生物安全预警中的应用空白。

　　

随着全球化进程加速，国际旅行和贸易的复苏使得病原体跨境传播风险显著提升。海关作为防控传染病输入的第一道防线，其环境微生物监测对早期预警至关重要。然而，传统培养方法难以全面评估复杂环境中的微生物群落，尤其是对未培养病原体的检测存在盲区。在此背景下，深圳海关国际旅行卫生保健中心的研究团队开展了一项创新性研究，通过宏基因组学技术对高风险口岸环境进行系统性监测，相关成果发表于《Biosafety and Health》。

研究团队采用高通量测序技术，于2024年7月至9月期间采集深圳皇岗口岸、宝安国际机场和深圳国际旅行卫生保健中心的126份环境样本，覆盖流行病学调查区、医学筛查室等6个关键区域。通过多重置换扩增(MDA)和NovaSeq 6000平台测序，结合自主开发的生物信息学流程，实现了从细菌、古菌到病毒的全谱系微生物检测。

研究结果揭示：1）微生物多样性特征：检出55类非病毒微生物和12种病毒，其中鸽圆环病毒与比利时株高度同源，H4N2禽流感病毒与亚洲禽类分离株相似；2）时空分布规律：病毒分布存在月份差异（χ²=21.06，P=0.002），7月巨型病毒检出率更高；3）风险分区模型：基于微生物丰度构建四级消毒体系，采样区桌面被列为关键消毒区；4）潜在病原体：发现2株具有跨物种传播潜力的病毒，其中H4N2病毒基因组覆盖率达98.9%。

讨论部分强调，该研究首次将环境宏基因组学应用于口岸生物安全监测，提出的四级消毒策略可优化资源配置。尽管存在采样时长有限、未验证微生物活性等局限，但研究为建立跨境病原体早期预警系统提供了方法论框架。特别是对禽流感病毒的环境检测，可能早于临床病例出现，这对防范新发传染病输入具有重要战略意义。未来需结合旅行者流动数据，进一步完善口岸生物安全风险评估体系。