
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
综述:生物医学研究中物理信息机器学习的近期进展与应用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月16日 来源:Current Opinion in Biomedical Engineering 4.7
编辑推荐:
【编辑推荐】本综述系统阐述了物理信息机器学习(PIML)如何通过融合生物物理定律与数据驱动方法(如物理信息神经网络/PINN、本构人工神经网络/CANN、神经常微分方程/NeuralODE),在心血管病、肿瘤学等生物医学领域提升模型精度与可解释性,同时探讨了频谱偏差等挑战与未来转化潜力。
生物医学研究致力于解析生命系统的生理与病理机制,而传统简化模型常忽略多物理场耦合效应。物理信息机器学习(PIML)通过将质量守恒、电生理动力学等先验知识嵌入机器学习(ML)框架,显著提升了复杂生物系统建模的鲁棒性。例如,在心肌电传导模型中,物理信息神经网络(PINN)通过纳维-斯托克斯方程约束,将预测误差降低达37%。
物理引导的架构设计是PIML的核心:
PINN:采用偏微分方程(PDE)残差作为损失项,成功应用于脑肿瘤生长预测
本构人工神经网络(CANN):将胡克定律等本构关系编码至网络权重,用于软骨力学特性分析
神经常微分方程(NeuralODE):通过可微分解算器模拟药物代谢动力学,但需注意其对离散事件(如细胞凋亡)的建模局限
在心血管领域,PINN融合血流动力学参数后,主动脉瘤破裂风险预测AUC达0.92。肿瘤学中,CANN整合PET-CT影像与生物热方程,实现放疗剂量分布优化。值得注意的是,神经内分泌模型采用NeuralODE耦合激素振荡方程,首次重现了胰岛β细胞的钙离子波动周期(R2=0.89)。
频谱偏差问题导致高频特征(如ECG信号R波)捕获困难,而生物系统常见的分岔行为(如癫痫发作阈值)需要新型激活函数设计。此外,跨尺度建模(分子-器官层次)仍面临计算效率与保真度平衡难题。
PIML正推动生物医学研究从"黑箱"向"白箱"范式转变。未来突破可能源于:① 引入注意力机制处理多时空尺度数据;② 开发生物启发的离散-连续混合架构;③ 建立标准化PIML生物医学基准数据库。正如前列腺癌液体活检模型所示,物理约束使小样本学习F1-score提升21%,印证了PIML在精准医疗中的独特价值。
生物通微信公众号
知名企业招聘