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环境样本中环孢子虫、沙门氏菌及鼠诺如病毒核酸提取方法的效能评估与比较研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月17日 来源:Journal of Microbiological Methods 1.7
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针对环境样本中病原体核酸提取方法缺乏性能数据的问题,研究人员评估了PowerViral、UNEX和PowerSoil三种方法对环孢子虫(C. cayetanensis)、沙门氏菌(S. enterica)和鼠诺如病毒(MNV)的回收效率。结果表明PowerViral方法在水体样本中检测稳定性最佳(83-100%),而UNEX方法在污泥中表现突出(4-36%),为环境病原监测提供了关键技术支撑。
在食品安全领域,一种名为环孢子虫(Cyclospora cayetanensis)的球虫寄生虫正引发持续关注——它不仅是食源性环孢子虫病爆发的元凶,更导致每年大量新鲜农产品召回事件。近年来,美国农产品种植区周边水体中频繁检出该病原体,但环境样本检测面临两大技术瓶颈:目标核酸含量极低且存在分子抑制剂干扰,现有提取方法缺乏系统性能评估数据。
为攻克这一难题,研究人员在《Journal of Microbiological Methods》发表重要研究成果。团队选取三种典型环境样本(地表水、农产品冲洗水、自来水)和污水污泥,以环孢子虫为研究核心,同步评估食源性致病菌沙门氏菌(Salmonella enterica)和病毒替代物鼠诺如病毒(MNV)的检测效能。研究创新性地对比了专为环境样本设计的PowerViral、UNEX方法,以及适用于污泥的PowerSoil方法(2?g)。
关键技术方面,研究采用人工接种定量方式,通过实时荧光定量PCR检测核酸回收率。样本队列包括三类水体和市政污水污泥,重点评估不同基质对提取效率的影响。实验设计严格遵循环境微生物学规范,确保数据可比性。
【水样检测结果】
PowerViral方法展现出卓越的稳定性,对环孢子虫、沙门氏菌和MNV的检出率高达83-100%,且不受水体类型影响。UNEX方法表现呈现两极分化:在自来水和冲洗水中检出率为56-100%,但地表水样本竟全军覆没(0%检出),揭示该方法对复杂水体的适应性缺陷。
【污泥检测结果】
PowerSoil方法对环孢子虫的回收率惨淡(≤1%),而PowerViral和UNEX方法则实现4-36%的突破性回收,证明传统土壤提取方案并不适用于寄生虫检测,必须开发专用技术路线。
【交叉病原体验证】
研究首次证实PowerViral方法具有广谱适用性,对细菌(沙门氏菌)、病毒(MNV)和真核寄生虫(环孢子虫)均保持高灵敏度。这种"一法多检"特性显著提升环境病原体筛查效率。
该研究为环境健康监测提供了关键方法学支持:首先确立PowerViral作为水体多病原检测的金标准,其稳定性能满足突发疫情溯源需求;其次揭示UNEX方法在污泥检测中的独特优势,为污水处理厂生物风险评估开辟新途径;最后警示科学界需针对不同环境基质优化提取方案,特别是破解地表水抑制物作用机制。这些发现对完善美国农产品安全生产体系、建立环境病原体早期预警系统具有重要实践意义。
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