基于SingleM与Sandpiper的宏基因组微生物物种分类鉴定新技术揭示环境微生物群落中未知物种的主导地位

【编辑推荐】针对宏基因组数据中微生物分类学鉴定难题，研究人员开发了基于通用标记基因(SingleM)的创新方法，结合Sandpiper平台整合248,559个公共宏基因组数据，首次证实环境微生物群落中未知物种占主导地位，为微生物组研究提供了突破性技术框架。

　　

通过分析宏基因组数据中高度保守的通用标记基因区域，SingleM技术实现了微生物物种分类学鉴定与相对丰度评估。该研究突破性地发现，在大多数环境微生物群落中，未被基因组数据库收录的未知物种占据主导地位。配套构建的Sandpiper网络平台系统整合了来自248,559个公开宏基因组的数据资源，为微生物生态学研究提供了前所未有的物种分辨率。这种基于标记基因保守区的分析方法，有效克服了传统宏基因组研究中参考数据库覆盖度不足的技术瓶颈。