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苯并二氧杂环戊烯与溴代呋喃桥联1,2,4-三唑杂合体的设计合成及其抗乳腺癌活性研究——基于计算模拟的机制探索
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月17日 来源:Scientific Reports 3.8
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本研究针对乳腺癌治疗中化疗耐药性这一临床难题,设计合成了一系列新型苯并[d][1,3]二氧杂环戊烯与5-溴代呋喃桥联的1,2,4-三唑杂合体。通过MTT法证实化合物12b对MCF-7细胞系具有显著抑制活性(IC50 3.54±0.265 μg/mL),结合分子对接、分子动力学模拟和DFT计算揭示了其与雌激素受体α(ERα)的稳定结合模式,为开发新型抗乳腺癌药物提供了结构优化方向。
乳腺癌作为全球女性发病率最高的恶性肿瘤,每年新增病例达180万例,其中三阴性乳腺癌(TNBC)和激素受体阳性亚型尤为棘手。现有化疗药物如阿霉素和紫杉醇面临严峻的耐药性问题——超过90%的转移性患者治疗失败,25%患者出现原发性耐药。这种耐药机制涉及DNA修复增强、药物外排泵激活等多重因素,而传统细胞毒性药物缺乏肿瘤选择性又导致严重毒副作用。面对这一困境,1,2,4-三唑类化合物因其独特的抗癌机制(如已上市药物来曲唑的结构基础)成为研究热点。
印度Manipal高等教育学院化学系的Manjunath R团队在《Scientific Reports》发表研究,通过四步合成法构建了6个新型杂合体分子,将具有生物活性的苯并[d][1,3]二氧杂环戊烯或5-溴代呋喃模块与1,2,4-三唑核心结构偶联。研究采用MTT法评估抗增殖活性,结合Glide分子对接(靶向ERα,PDB ID:3ERT)、200 ns分子动力学模拟(Desmond模块)和DFT计算(B3LYP-D3/6-31Gss基组)等计算手段,系统揭示了构效关系。
关键实验技术
杂合体合成:采用异硫氰酸酯介导的环化反应构建1,2,4-三唑核心
活性评价:MTT法测定MCF-7细胞(源自NCCS Pune)增殖抑制
计算模拟:分子对接预测结合模式,分子动力学评估复合物稳定性(MM-GBSA结合自由能-58.5364 kcal/mol)
理论计算:DFT分析前沿分子轨道能隙(△E=4.608 eV)和分子静电势(MEP)
研究结果
化学合成
通过酯化、肼解、异硫氰酸酯加成和碱介导环化四步反应,以72-89%收率获得目标化合物。核磁共振(1H NMR)显示δ 13.8 ppm特征硫醇峰,质谱(m/z 340.11)证实化合物12b结构正确。
体外抗癌活性
5-溴代呋喃衍生物12b展现最强活性(IC50 3.54 μg/mL),优于苯并二氧杂环戊烯类似物6a(7.989 μg/mL)。氟取代基(12b)比甲基(12a)活性提高3.6倍,表明卤素原子对药效的关键作用。
计算模拟
分子对接显示12b与ERα形成稳定疏水作用(TRP383、LEU384等),其对接得分(-8.299 kcal/mol)显著优于阿霉素(-6.667 kcal/mol)。200 ns动力学模拟证实复合物RMSD稳定在1-3 ?,关键相互作用保持率:GLY521氢键(55%)、TRP383 π-π堆积(46%)。
DFT分析
化合物12b具有最小能隙(4.608 eV)和最高电负性(χ=3.475),MEP图显示其噻吩环区域易受亲核攻击,与生物活性正相关。
结论与意义
该研究通过"杂交药效团"策略成功开发出具有临床应用前景的抗乳腺癌先导化合物。特别值得注意的是:
5-溴代呋喃模块通过卤键相互作用显著提升活性,其IC50值接近临床药物水平
计算模拟与实验数据高度吻合,证实ERα是潜在作用靶点
所有衍生物符合Lipinski五规则(logP=3.3-4.3)和Jorgensen三规则(Caco-2渗透性>2462 nm/sec),预示良好成药性
这项研究为克服乳腺癌耐药性提供了新思路,其特色在于:
首次系统研究溴代呋喃-三唑杂合体的抗乳腺癌活性
建立多尺度计算模型指导结构优化
发现氟原子取代与活性提升的量化关系
未来研究可进一步探索该类化合物对HER2+和TNBC亚型的活性,以及体内药效学特征。该成果发表于《Scientific Reports》也体现了计算化学在抗癌药物设计中的关键作用。
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