克罗地亚生态系统中猪源A型轮状病毒的跨物种传播与基因组异质性研究

本研究采用"One Health"时空方法，首次系统分析了克罗地亚家猪与野生动物（野猪、赤狐和金豺）间猪源轮状病毒A（poRVA）的遗传关联性。通过VP7/VP4基因分型和全基因组测序，证实了野生动物poRVA与家猪毒株的进化关联，发现G3/G5/P[13]等关键基因型及重组事件，填补了野生犬科动物RVA基因组数据空白，为跨物种传播风险预警提供了重要依据。

　　

在人与动物共患病日益频发的背景下，轮状病毒A型（Rotavirus A, RVA）作为引起婴幼儿和幼畜胃肠炎的主要病原体，其跨物种传播机制始终是学界关注焦点。尽管已知家猪可作为RVA的重要宿主，但野生动物在病毒传播网络中的角色仍如"生态黑箱"。克罗地亚科学家团队通过为期三年的系统监测，首次揭示了该国生态系统中家猪与野生动物间猪源RVA（poRVA）的复杂传播链条。

研究团队采用"One Health"时空研究框架，对2018-2021年间采集的1550份样本（来自家猪、野猪、赤狐和金豺）进行系统分析。通过RT-PCR筛选、VP7/VP4基因分型（G/P分型）和Illumina NextSeq 500平台测序，成功获得19个poRVA全基因组数据。创新性地运用Simplot软件进行基因组重组分析，揭示了野生动物在RVA传播中的特殊地位。

主要研究发现

1. 基因组特征：所有毒株均呈现猪基因群1型基因组构象，表面蛋白基因型具有典型的宿主特异性。首次报道了亚洲以外地区野猪、全球第二例赤狐和首例金豺的RVA全基因组数据。
2. 基因型分布：VP7基因中G3型在野生动物占优势（61%），家猪则以G5型为主（58%）；VP4基因中P[13]为最流行型别（47%），同时检测到P[23]-P[6]重组事件。
3. 跨物种传播证据：系统发育分析证实野生动物poRVA与家猪毒株存在直接进化关联，特别是金豺携带的毒株与家猪G4P[6]型（具人兽共患潜力）高度同源。
4. 混合感染现象：仅在家猪中发现包含VP7、VP4和NSP4基因的混合基因型RVA，提示家猪可能是基因重配的"熔炉"。

这项发表于《Science of The Total Environment》的研究具有多重科学价值：首次建立了克罗地亚野生动物RVA基因组数据库，证实了野生犬科动物在传播人兽共患型RVA中的潜在作用。发现的P[13]基因型优势分布和G4P[6]人兽共患型毒株，为区域性RVA防控提供了精准靶点。研究强调在城市化加速的背景下，应采用"One Health"策略监测人-家畜-野生动物界面处的病毒演化，这对预测新发传染病风险具有重要启示。正如作者指出，野生动物如同"行走的病毒库"，其与家畜的生态接触网络或将成为未来人兽共患病防控的关键环节。