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黄芪活性成分调控结直肠癌关键靶点的生物信息学机制研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月17日 来源:Current Medicinal Chemistry 3.5
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本研究针对结直肠癌(CRC)治疗需求,通过整合传统中药系统药理学数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据,系统解析了黄芪(Astragalus membranaceus)20种活性成分及其1403个靶基因。研究筛选出2300个差异表达基因和3035个枢纽基因,鉴定出86个关键差异靶基因(DTGs),揭示828个GO生物过程、184个分子功能及46条KEGG通路。创新性构建了45对mRNA-TF调控网络、101对miRNA-mRNA互作及200个miRNA-mRNA-TF三元组,并通过分子对接验证了槲皮素与F2/UGT1A1、甲酸与FGA/AHSG/KNG1的结合特性,为CRC精准用药提供了新依据。
这项开创性研究运用多组学联析策略,深度挖掘了传统中药黄芪在结直肠癌(CRC)治疗中的分子机制。通过系统药理学方法筛选出20种具有抗癌潜力的黄芪活性成分,包括明星化合物槲皮素(quercetin)和甲酸(formic acid)。借助TCGA数据库,研究人员绘制了CRC患者基因表达谱,锁定2300个差异表达基因和3035个枢纽基因。
巧妙整合中药靶标与肿瘤差异基因后,86个关键差异靶基因(DTGs)浮出水面。这些基因涉及凝血因子F2、药物代谢酶UGT1A11以及血浆蛋白FGA/AHSG/KNG1等重要靶点。功能富集显示,这些DTGs显著富集于828条生物过程、184种分子功能,并激活46条癌症相关信号通路,如PI3K-Akt和Wnt通路。
研究亮点在于构建了多维调控网络:45对mRNA-转录因子(TF)调控关系、101对miRNA-mRNA互作模块,以及200个复杂的miRNA-mRNA-TF三元调控网络。Autodock Vina分子对接证实,槲皮素与F2/UGT1A1、甲酸与FGA/AHSG/KNG1具有优越的结合特性,结合能均<-5kcal/mol,为中药成分抗癌机制提供了结构生物学证据。
这项研究不仅解码了黄芪"多成分-多靶点-多通路"的抗癌作用网络,更为CRC精准治疗提供了可量化的生物标志物和潜在干预靶点,架起了传统中药与现代精准医学的桥梁。
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