欧洲高致病性禽流感暴发的预测模型构建与关键驱动因素解析:一项基于机器学习的生态气候研究

【字体: 时间:2025年07月18日 来源:Scientific Reports 3.8

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  本研究针对高致病性禽流感(HPAI)在欧洲的暴发机制不明、预测困难等问题,通过机器学习方法构建了准确率达94%的预测模型。研究人员整合气候、环境、野生鸟类等多源数据,首次在NUTS3地理尺度上揭示温度、水体指数(NDWI)、植被指数(NDVI)和家禽密度等关键驱动因素的季节性影响规律,特别是发现疣鼻天鹅(Cygnus olor)在病毒传播中的重要作用。该研究为禽流感早期预警系统提供了科学依据,对防范病毒跨种传播具有重要意义。

  

禽流感病毒(HPAI)近年来呈现令人担忧的上升趋势,不仅造成养殖业重大经济损失,更因跨物种传播风险引发公共卫生担忧。2022-2023年北半球爆发的大规模疫情再次敲响警钟,而H5N1病毒在哺乳动物中的感染案例不断增加——从水貂、家猫到奶牛场工人,这些事件清晰表明病毒正在突破物种屏障。然而,究竟是什么因素驱动着这些疫情暴发?野生候鸟与家禽之间的病毒传播如何受环境调控?这些关键问题长期困扰着科学界。

为解开这些谜团,海德堡大学全球健康研究所(Heidelberg Institute of Global Health)与乌梅?大学的研究团队在《Scientific Reports》发表了一项开创性研究。他们创新性地将机器学习与生态流行病学相结合,构建出能动态预测欧洲禽流感暴发的精准模型,同时揭示了温度、水体环境和家禽密度等关键驱动因素的复杂作用机制。

研究人员采用了三项核心技术方法:首先整合世界动物卫生组织(WOAH)2006-2021年欧洲HPAI暴发数据与哥白尼气候服务系统的生态气候变量;其次运用XGBoost算法构建三种预测模型,通过SHAP值解析特征重要性;最后采用空间交叉验证技术解决地理聚集性问题,并用2022-2023年数据进行真实样本外验证。特别值得注意的是,研究将野生鸟类暴发数据转化为预测特征,首次量化了不同鸟种在病毒传播中的作用。

【模型构建与验证】

研究团队开发了三个梯度提升树模型,其中包含野生鸟类特征的M2模型表现最优,测试集准确率达94%,真实样本外预测准确率88%。模型成功捕捉到法国西部、德国北部等实际暴发热点区域,仅少数地区出现假阳性预测。温度季节性(bio3)与禽类密度的交互作用被证实是影响预测精度的关键因素。

【关键驱动因素】

SHAP分析显示:1)第三季度最低温度(min_temp_q3)呈U型影响,极端低温或高温都增加风险;2)春季平均温度(mean_temp_q2)降低会显著减少暴发概率;3)第一季度水体指数(ndwi_q1)和第四季度植被指数(ndvi_q4)下降对应风险降低。这些发现印证了低温环境有利于病毒存活,而水鸟聚集行为受水资源季节性分布影响的假设。

【野生鸟类作用】

在研究的260种鸟类中,疣鼻天鹅(Cygnus olor)的SHAP值贡献最高,其次是鸥科(Laridae)和雁形目(Anseriformes)物种。模型显示这些候鸟与温度季节性(bio4)存在强交互作用,解释了为何H5N1疫情多发生在冬季候鸟迁徙期。这一发现与德国、荷兰等地既往的基因溯源研究相互印证。

【家禽密度影响】

家禽密度被证实为第四大重要特征,高密度区域显著提升暴发风险。模型预测的高风险区与实际养殖密集区高度吻合,表明农场间传播仍是重要扩散途径。有趣的是,当模型屏蔽野生鸟类数据时,家禽密度的预测权重进一步提升,暗示两种传播途径可能并存。

在讨论部分,作者指出这项研究首次实现了欧洲高分辨率禽流感预测,其价值体现在三方面:一是揭示了温度波动通过影响病毒环境存活期和鸟类聚集行为双重机制驱动疫情;二是量化了不同野生鸟类物种的传播贡献,为哨兵监测指明重点物种;三是证明结合卫星环境数据与养殖场信息可构建精准预警系统。特别是模型预测的"高风险窗口期"——冬季低温结合水体结冰迫使水鸟集中到有限未结冰区域,创造了病毒扩散的理想条件,这为实施季节性防控措施提供了科学依据。

研究也承认存在一定局限,如未能区分不同HPAI病毒株系的差异,且野生鸟类种群密度数据缺失。作者建议未来应整合病毒基因组数据,并开发"物理-机器学习"混合模型来捕捉风向等传播因素。这些发现不仅为动物防疫提供工具,更通过"同一健康"(One Health)视角,为防范禽流感病毒跨种传播至人类积累了关键科学证据。

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