稳定性参数与选择模型的协同作用:多环境试验中优异大麦基因型鉴定的新策略

【字体: 时间:2025年07月18日 来源:BMC Research Notes 2.8

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  本研究针对多环境试验(METs)中基因型-环境互作(GEI)效应解析的挑战,创新性地整合31种稳定性参数与MGIDI、FAI-BLUP选择模型,开发了改良R脚本分析流程。伊朗农业研究团队通过20个大麦基因型的10环境测试,发现G3、G4、G6等基因型兼具高产稳产特性,为暖区大麦育种提供了可靠的决策工具,相关方法发表于《BMC Research Notes》。

  

在作物育种领域,一个长期困扰科学家的难题是:如何从成千上万的候选品种中筛选出既高产又适应不同环境的"全能选手"?这个问题源于基因型与环境之间复杂的互作关系(Genotype-by-Environment Interaction, GEI),就像同样的学生在不同老师手下表现迥异。传统方法往往顾此失彼——要么只关注产量忽视稳定性,要么过度追求稳定而牺牲产量潜力。位于伊朗卡拉杰的种子与植物改良研究所(Seed and Plant Improvement Institute, AREEO)的Alireza Pour-Aboughadareh团队在《BMC Research Notes》发表的研究,为解决这一困境提供了创新方案。

研究人员采用多学科交叉方法,首先通过随机区组设计在伊朗5个暖区环境进行两年大麦试验,收集18个新品系与2个对照品种的产量数据。运用STABILITYSOFT和R语言metan包计算31种稳定性参数,包括Shukla方差(σ2)、Wricke生态价(W2)等经典指标。创新性地将AMMI(加性主效应乘性交互作用)分析与BLUP(最佳线性无偏预测)模型结合,开发改良R脚本实现MGIDI(多性状基因型-理想型距离指数)和FAI-BLUP(基于因子分析的理想型设计指数)的自动化计算。

研究结果显示,环境因素解释68%产量变异(P<0.01),基因型贡献7%,GEI占25%。AMMI分析提取6个显著交互主成分(IPCAs),其中IPC1解释40.3%变异。通过MGIDI模型筛选发现,G2、G14等基因型在7个主成分(累计解释96.1%变异)中表现最优,其BLUP参数(HMGV、RPGV)选择差(SD%)达+7.18%。FAI-BLUP模型则验证G2、G3、G6兼具高产(SD% +8.26%)与稳产特性(WAASB稳定性参数降低8.89%)。

特别值得注意的是,传统ASR(平均秩次)方法仅能识别稳定基因型(如G8、G10),而新方法可同步评估产量与稳定性。维恩图分析显示G2、G6、G14被两种模型共同推荐,其中G2作为已审定品种的优异表现验证了方法的可靠性。

这项研究的意义在于:首先,建立首个整合31种稳定性参数的选择模型框架,解决传统方法结论不一致的难题;其次,开发的R脚本(如ideotype=c("h,h,h,h,h,l...")参数设置)使育种家能自定义选择标准;最后,鉴定的G3、G4、G6等基因型为伊朗暖区大麦生产提供新材料。正如作者强调的,该方法可扩展到其他作物性状分析,为应对气候变化下的品种选育提供普适性工具。研究也指出需在不同生态区验证模型适用性,这正是团队下一步的工作方向。

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