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新疆哈萨克族食管鳞癌全外显子测序揭示新型体细胞变异及其侵袭机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月18日 来源:Pathology - Research and Practice 2.9
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针对新疆哈萨克族食管鳞癌(XK ESCC)高死亡率问题,研究人员通过全外显子测序(WES)分析4对肿瘤-癌旁组织,鉴定出14个潜在驱动基因及IFNA17/NLRP6在NOD样受体通路中的促侵袭突变,为高发区精准诊疗提供新靶点。
食管鳞状细胞癌(ESCC)在中国呈现"东高西低"的发病特征,而新疆哈萨克族群体的死亡率却异常突出。传统饮食如发酵乳制品、高温烤肉产生的多环芳烃(PAHs),以及高海拔环境因素共同构成了独特的风险图谱。更严峻的是,超过半数患者确诊时已属晚期,PI3K、NOTCH1等已知基因突变无法完全解释其侵袭特性。这种"地域性发病谜团"催生了新疆医科大学附属肿瘤医院研究团队的创新探索。
研究人员采用全外显子测序(WES)技术,对4例哈萨克族ESCC患者的肿瘤组织及配对白细胞样本进行深度分析。通过GATK标准流程,结合GO/KEGG功能富集,系统描绘了XK ESCC的基因变异图谱。研究发现14个携带错义突变的潜在驱动基因,其中IFNA17和NLRP6的突变在NOD样受体信号通路显著富集。体外实验证实,这些突变体可增强癌细胞侵袭能力。这是首次针对新疆哈萨克族ESCC的全面基因组学研究,相关成果发表于《Pathology - Research and Practice》。
临床样本
研究纳入2023-2024年新疆医科大学附属肿瘤医院收治的4例哈萨克族ESCC患者,采集超过4ml外周血建立对照样本,所有操作均符合赫尔辛基宣言伦理规范。
全外显子测序揭示XK ESCC复杂突变谱
WES分析鉴定出75个显著突变基因(SMGs),包括TP53、PIK3CA等已知基因,同时发现14个新型候选驱动基因。拷贝数变异(CNV)分析显示染色体8q24.3等区域扩增与肿瘤进展相关。
讨论
相比汉族ESCC,哈萨克族患者存在独特的IFNA17突变热点,该基因编码干扰素α家族成员,可能通过JAK-STAT通路影响肿瘤微环境。NLRP6突变体则可能通过炎症小体激活促进上皮-间质转化(EMT)。
结论
该研究不仅填补了少数民族ESCC基因组学空白,更发现NLRP6-IFNA17轴可能是解释XK ESCC高侵袭性的关键。新疆自治区自然科学基金(2022D01C514/519)等资助的后续研究将重点验证这些突变作为液体活检标志物的潜力。
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