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基于LSU基因的巢式PCR和实时定量PCR技术早期检测花椒锈病菌(Coleosporium zanthoxyli)
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月18日 来源:Physiological and Molecular Plant Pathology 2.8
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本研究针对花椒锈病早期诊断难题,开发了基于LSU基因的巢式PCR(最低检测限2.5 pg/μL)和qPCR(灵敏度250 fg/μL)检测体系,可在无症状期精准识别病原菌Coleosporium zanthoxyli,为病害早期预警提供分子工具。
花椒作为我国特色经济树种,其叶片常遭受锈病菌Coleosporium zanthoxyli的侵袭。这种病原菌能在宿主无症状阶段潜伏,待病症显现时已通过气流快速传播,传统化学防治往往为时已晚。更棘手的是,现有技术难以在病害早期实现精准诊断,导致防控窗口期被严重延误。针对这一产业痛点,四川农业大学森林病理实验室的研究团队在《Physiological and Molecular Plant Pathology》发表论文,开发出两种高灵敏度分子检测技术,为破解花椒锈病防控难题提供了新方案。
研究人员采用巢式PCR和实时定量PCR(qPCR)技术,以病原菌保守的LSU基因为靶标,通过优化反应条件建立检测体系。实验选用20株菌株(包括四川地区采集的花椒病叶分离株及其他植物锈病菌对照株),通过梯度退火温度测试确定最佳扩增参数,并采用人工接种与自然感染样本进行验证。
【Optimization of the Reaction Conditions of Nested PCR】
研究发现当退火温度为53°C时,引物LSU4-F/LSU4-R能稳定扩增出451bp目标条带,而其他温度区间易产生杂带。这为巢式PCR的特异性扩增提供了关键参数。
【DISCUSSION】
相较于传统ITS序列,LSU基因在锈病菌检测中表现出更高稳定性。研究揭示qPCR技术对早期无症状感染的检出率比常规方法提升两个数量级,可在病原菌含量极低(250 fg/μL)时实现精准识别。
【CONCLUSION】
该研究首次建立的花椒锈病菌分子检测体系,将病害识别时间大幅提前。其中巢式PCR检测限达2.5 pg/μL,qPCR灵敏度更高达250 fg/μL。这不仅为田间监测提供了"分子雷达",更开创了通过早期干预阻断病害传播的新途径。
值得关注的是,团队发现退火温度对PCR特异性具有决定性影响——53°C的精确控制使非特异性扩增完全消失。这种"温度窗口"现象的揭示,为其他植物病原真菌的分子检测提供了重要参考。研究还指出,未来通过优化引物设计和挖掘更多保守基因序列,可进一步提升检测体系的普适性。
这项由Shan Han团队主导的研究,通过Yujue Zhou、Chunlin Yang等成员的协作攻关,最终将分子植物病理学理论与实际应用需求紧密结合。其成果不仅适用于花椒锈病防控,所建立的技术框架还可拓展至其他经济作物的病害早期预警系统,为农业可持续发展提供了创新性解决方案。
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