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基于VGG网络与显微-衍射图像融合的芽殖酵母识别新方法在成像流式细胞术中的应用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月18日 来源:Scientific Reports 3.8
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本研究针对显微-衍射成像流式细胞术(MDIFC)在细胞亚群分类中存在的精度不足、处理速度慢等问题,创新性地提出将图像融合技术与VGG-net深度学习算法相结合的方法。研究人员以芽殖酵母为模型,通过加权融合显微(a=0.2)与衍射图像(a=0.8),构建VGG11网络实现单细胞、芽殖细胞和聚集细胞的三类分类,最终达到0.98的分类准确率和260.42 cells/s的高通量性能,较传统GLCM-SVM/RF方法提升15倍效率。该成果为无标记细胞分析提供了自动化解决方案,在生物医学高通量检测领域具有重要应用价值。
在单细胞分析领域,显微成像技术虽能提供精细的形态学信息,却难以实现高通量检测;而流式细胞术虽具备高速优势,但传统方法依赖荧光标记且分辨率有限。这种矛盾在酵母细胞研究中尤为突出——作为真核生物研究的模式生物,芽殖酵母(Saccharomyces cerevisiae)的细胞周期监测需要同时获取形态特征和群体分布信息。更棘手的是,现有基于灰度共生矩阵(GLCM)的机器学习方法在MDIFC系统中存在双重瓶颈:处理衍射图像时特征提取耗时长(58.67ms/样本),而单独分析显微图像又因缺乏纹理特征导致分类准确率不足。
针对这一技术痛点,天津大学精密测试技术及仪器国家重点实验室的Yangguang Han团队在《Scientific Reports》发表创新性研究。他们巧妙地将532nm激光衍射成像与450nm LED显微成像相结合,通过偏振分光系统同步捕获细胞的双模态图像。研究核心突破在于:采用加权融合算法Gf=Gm×α+Gd×(1-α),构建包含3,329组数据的训练集(含687个芽殖事件),并设计11层VGG-net架构(含8个3×3卷积核的ReLU层)。实验证明,当显微图像权重α=0.2时,融合图像使分类准确率提升至98.09%(F1-score 0.9867),远超SVM(96.10%)和RF(92.10%)。更值得注意的是,该系统将处理速度提升至260.42 cells/s,比GLCM特征提取方法快15倍,首次实现无标记酵母细胞的高通量自动分类。
关键技术方法包括:1)搭建双光路MDIFC系统(含532nm激光器和450nm LED);2)制备1×106 cells/mL酵母悬液;3)建立加权图像融合算法;4)构建轻量化VGG11网络(含Dropout层);5)采用10折交叉验证评估性能。
【研究结果】
数据集准备:使用3,329个事件(2,330训练/999测试),包含单细胞(806)、芽殖细胞(687)和聚集细胞(837)三类,样本分布如图1所示。

图像融合权重影响:如图2显示,α=0.2时融合图像分类效果最优(显微α=1.0时准确率最低),证实衍射图像(α=0)比显微图像包含更多可分性特征。

算法性能对比:VGG-net在α=0.2融合图像上的表现全面领先(表1),特别是对芽殖细胞的识别精确度达99.24%。混淆矩阵(图3)进一步显示其错分率仅1.89%,显著低于SVM(3.90%)和RF(7.90%)。

速度优势:如表2所示,VGG-net省去GLCM特征提取环节,使总处理时间降至3.84ms/样本,较传统方法(58.67ms)实现量级突破。
这项研究开创性地将深度学习与多模态成像融合,其价值体现在三方面:首先,α=0.2的融合策略证明衍射图像携带更多三维折射率分布信息(通过532nm激光散射获取),这与前人关于衍射图像GLCM特征优越性的发现相符;其次,VGG-net的3×3卷积核能自适应提取双模态特征,克服了手工设计特征(如Haralick纹理)的局限性;最后,260.42 cells/s的吞吐量使该系统可应用于实时监测酵母培养过程,为发酵工程质量控制提供新工具。正如作者指出,该方法未来可扩展至白细胞分类等医学场景,但需注意不同细胞类型可能需要调整融合权重α——这正体现了MDIFC技术"可编程分析"的独特优势。
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