基于BSA-Seq的东方甜瓜XNM125与XNM020果实长度调控位点遗传定位研究

为解决野生甜瓜与栽培品种果实长度(FL)遗传调控机制不明的问题，研究人员通过杂交短果型野生agrestis甜瓜XNM020与长果型栽培flexuosus甜瓜XNM125，构建F2分离群体，结合BSA-Seq和InDel标记定位，在3号染色体(7.33–23.99 Mb)发现主效QTLqFL3.1，解析了12个涉及细胞周期/分裂、激素信号等通路的关键候选基因，为甜瓜分子育种提供新靶点。

　　

果实长度(FL)作为典型的数量性状位点(QTL)调控特征，对甜瓜产量和外观品质具有决定性作用。从短果型野生甜瓜到超长果型flexuosus栽培品种，甜瓜种质资源中存在显著的FL遗传多样性。尽管此前研究多集中于栽培甜瓜各园艺亚群，野生甜瓜FL调控位点仍属未解之谜。

为此，研究者将短果型野生agrestis甜瓜XNM020与超长果栽培flexuosus甜XNM125杂交，构建F₂分离群体。2022年春和2023年秋两季种植数据显示，FL在群体中呈连续分布，证实了该性状的定量遗传特征。基于混池测序(BSA-Seq)技术，在3号染色体7.33–23.99 Mb区间锁定FL变异相关基因组区域，后续通过InDel标记进行QTL定位，验证了主效QTLqFL3.1的存在，其可解释18.54%的表型变异。

通过对目标区域多态性SNP和InDel的注释及功能预测，筛选出12个关键候选基因，这些基因涉及细胞周期/分裂、植物激素信号转导、微管运动及细胞壁生物合成/组织等生物学过程，可能是导致XNM020与XNM125 FL差异的遗传基础。该研究不仅深化了对甜瓜FL遗传调控的认知，更为分子标记辅助选择育种提供了宝贵的基因组资源。