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单细胞与批量转录组整合分析揭示肺腺癌中T细胞应激亚型的免疫治疗抵抗机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月19日 来源:Discover Oncology 2.8
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本研究针对肺腺癌(LUAD)肿瘤微环境中T细胞应激状态(Tstr)与免疫治疗抵抗的关键问题,通过整合单细胞和批量转录组数据,系统解析了以热休克蛋白家族(HSPA1A/HSPA1B)为核心的Tstr亚型特征。研究人员发现C1亚型呈现"冷肿瘤"表型且预后不良,构建了7基因预后模型(TRS),并通过实验验证CREG2促进肿瘤迁移增殖的功能。该研究为LUAD免疫治疗耐药机制提供了新靶点,发表于《Discover Oncology》。
肺癌长期占据全球癌症死亡率首位,其中肺腺癌(LUAD)占非小细胞肺癌(NSCLC)的40%,但五年生存率仅15%。肿瘤微环境(TME)的异质性导致的免疫治疗抵抗是主要瓶颈。近年研究发现,T细胞在应激状态(T cell stress response state, Tstr)下高表达热休克蛋白家族基因(HSPA1A/HSPA1B),这种特殊状态与多种癌症的免疫检查点抑制剂(ICI)抵抗相关,但在LUAD中的机制尚不明确。
为解决这一关键问题,蚌埠医学院呼吸系统疾病临床与基础研究安徽省重点实验室的研究团队开展了系统性研究。通过整合单细胞和批量转录组数据,首次在LUAD中建立了Tstr亚型分类体系,揭示了关键生物标志物CREG2的促癌机制,相关成果发表于《Discover Oncology》。
研究采用四大关键技术:1) 基于TCGA和GEO数据库获取498例LUAD样本的批量转录组数据,结合单细胞测序数据(4例正常/4例肿瘤)进行整合分析;2) 通过一致性聚类鉴定Tstr亚型,利用ESTIMATE、CIBERSORT等算法解析免疫微环境特征;3) 采用LASSO回归构建7基因预后模型(TRS),包含ABCC2、CREG2等关键基因;4) 通过体外实验验证CREG2对A549/PC9细胞迁移增殖的调控作用。
研究结果主要包括:
单细胞转录组景观特征
单细胞t-SNE降维识别出7种主要细胞类型,T细胞中Tstr评分显著高于其他细胞。

分子亚型与微环境特征
基于Tstr特征基因将LUAD分为C1/C2亚型,C1亚型高表达HSPA1A/HSPA1B且预后更差。

治疗响应预测
药物敏感性分析显示C1亚型对吉西他滨(Gemcitabine)、顺铂(Cisplatin)等6种化疗药耐药,但可能受益于吉非替尼(Gefitinib)。

预后模型与关键基因
构建的TRS模型在三个独立队列中均显示高评分组预后更差(AUC=0.7)。


该研究创新性地建立了LUAD中Tstr亚型的分类标准,揭示热休克蛋白家族介导的免疫抑制新机制。提出的TRS模型和CREG2靶点为临床预后评估提供了新工具,C1/C2亚型的治疗策略差异为精准免疫治疗奠定基础。研究局限性在于未开展动物实验验证CREG2的体内功能,未来需扩大单细胞队列进一步解析Tstr与Treg细胞的互作网络。这些发现为克服LUAD免疫治疗抵抗提供了理论依据和转化方向。
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