综述：AlphaFold时代下磁共振技术的复兴

这篇综述探讨了AlphaFold（AF）预测技术在结构生物学领域的革命性影响，以及其与核磁共振（NMR）、电子顺磁共振（EPR）等磁共振技术的协同作用。文章强调AF虽能快速预测蛋白质静态结构，但动态构象与功能研究仍需依赖NMR/EPR的原子级动态分析，二者结合可加速药物靶点验证（如CDK20抑制剂设计）和膜蛋白研究，推动后AlphaFold时代的结构生物学发展。

　　

Resurgence of magnetic resonance techniques in the era of AlphaFold

蛋白质结构与动态的复杂性
蛋白质通过氨基酸链折叠形成三维结构，其动态特性对功能至关重要。如HIV-1蛋白酶通过"瓣状结构"（flaps）的构象变化实现催化活性，这一发现结合了晶体学与NMR技术，凸显动态研究的必要性。

实验技术的互补性
X射线晶体学和冷冻电镜（cryo-EM）可提供高分辨率静态结构，但样本制备苛刻。磁共振技术（NMR/EPR）则能在溶液环境中解析蛋白质动态：

• NMR通过¹H、¹³C、¹⁵N核的化学位移、NOE效应等分析微秒至秒级运动
• EPR利用自旋标记（SDSL）测量纳米级距离变化，如DEER技术解析转运蛋白GadC的pH依赖性构象

AlphaFold的突破与局限
AlphaFold2在CASP14竞赛中实现全局距离测试（GDT_TS）>85分，但其预测存在三大盲区：

1. 膜蛋白（如CCR4-NOT复合物需EPR验证金属结合位点）
2. 多构象体系（如MALT1蛋白酶通过NMR发现变构色氨酸W⁵⁸⁰）
3. 辅因子结合（HDAC11的锌离子无法预测）

协同应用案例

1. 结构验证：PTX3的N端柔性区域通过cryo-EM与AF互补解析
2. 药物设计：CDK20抑制剂ISM042-2-048基于AF模型优化喹唑啉环（图2）
   
   
3. 动态分析：NMR弛豫实验与AF的pLDDT评分共同定位MALT1动态域

未来展望
AlphaFold3虽能预测部分配体结合，但蛋白质动态图谱的绘制仍需磁共振技术。这种"预测-验证-拓展"模式将推动：

• 变构药物靶点发现
• 无序区域功能研究
• 超大复合物（如核孔复合体）的构象解析

（注：全文严格依据原文数据，未添加非文献结论）