全基因组测序揭示长臂猿进化适应与保护的遗传学基础

为破解长臂猿保护遗传学难题，研究人员对4种Nomascus长臂猿开展全基因组测序，揭示其强遗传分化与基因流共存现象，发现与发声、果糖代谢等相关的自然选择特征，证实近交衰退导致心血管疾病和繁殖力下降的遗传风险，为濒危物种保护提供关键基因组学依据。

　　

在热带雨林的树冠层间，长臂猿以其标志性的臂跃行动和复杂的二重唱闻名，这些小型类人猿是生态系统健康的重要指示物种。然而，栖息地丧失、非法贸易和气候变化正将它们推向灭绝边缘。更严峻的是，长期以来对其遗传进化机制的认知空白，严重制约了保护措施的制定。以北京动物园、广州动物园等机构提供的37只长臂猿样本为基础，研究人员对4种冠长臂猿（包括中国境内已功能性灭绝的北部白颊长臂猿N. leucogenys）展开全基因组测序研究，相关成果发表于《Journal of Genetics and Genomics》。

研究采用17.94×深度的全基因组重测序技术，基于Asia_NLE_v1参考基因组进行比对（比对率99.53%），通过SNP（单核苷酸多态性）分析和群体遗传学方法，结合自然选择信号检测。样本涵盖11只北部白颊长臂猿、7只南部白颊长臂猿等4个濒危物种，部分样本来自NCBI数据库补充。

遗传分化与基因流
研究发现Nomascus属物种间存在显著遗传分化，但检测到持续的基因流现象，这与该属物种近期（500-600万年前）快速辐射进化的历史相符。

自然选择特征
基因组扫描鉴定出与发声、果糖代谢、运动平衡和体型相关的选择信号，解释了长臂猿独特的表型适应性。例如发声相关基因的进化可能与其复杂的二重唱行为相关。

遗传衰退风险
近交导致的有害突变积累显著影响心血管系统和繁殖能力，种群历史分析显示气候变迁和人类活动共同造成遗传多样性降低，北部白颊长臂猿等物种的进化潜力已严重受损。

这项研究首次系统揭示冠长臂猿的基因组适应机制与遗传危机，为制定科学的迁地保护、种群复壮策略提供分子依据。研究者特别指出，针对检测到的有害突变，需在人工繁育中建立遗传管理方案，同时保护现存栖息地以维持自然基因流。数据已存入中国国家生物信息中心的基因组序列档案（GSA），将为全球长臂猿保护行动持续提供支持。