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新型环钯化单体与二聚体配合物的合成表征及抗菌活性研究:基于[Pd(PPh3)(bhquin)(sac)]的光谱学、分子对接与晶体结构解析
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月19日 来源:Journal of Organometallic Chemistry 2.1
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本研究针对环钯化配合物在生物活性与催化领域的应用瓶颈,通过设计合成[Pd(PPh3)(bhquin)(sac)]等新型单核/双核钯(II)配合物,结合IR、1H/31P-NMR、X射线衍射及DFT计算等多维表征,揭示了配体空间构型对分子结构的调控机制。分子对接证实其抗菌潜力,为开发新型金属基抗菌剂提供了理论依据。
在金属有机化学与药物化学的交叉领域,环钯化配合物因其独特的电子结构和配位特性,在抗癌药物开发、催化转化和功能材料等领域展现出巨大潜力。然而,这类化合物的实际应用长期受限于两个关键问题:一是配体空间构型对分子活性的调控机制不明确,二是传统合成方法产率低且结构可控性差。特别是在抗菌药物研发中,随着耐药菌株的持续涌现,开发基于新型作用机制的金属配合物已成为当务之急。
针对这些挑战,来自Imam Mohammad Ibn Saud Islamic University(伊玛目穆罕默德·本·沙特伊斯兰大学)的Zana S. Afandi团队在《Journal of Organometallic Chemistry》发表了创新性研究成果。研究人员以苯并喹啉(bhquin)和糖精(sac)为关键配体,通过精准调控单齿膦(PPh3)与双齿膦(dppm/dppe/dppp/dppb/dppf)配体的配位方式,成功构建了从单核[Pd(PPh3)(bhquin)(sac)]到双核[Pd2(sac)2(μ-p^p)(bhquin)2]的系列配合物,系统探索了结构-活性关系。
研究采用四大关键技术:1)桥连配体置换法合成前体[Pd2(bhquin)2(μ-sac)2],产率提升至91%;2)综合运用电导率测定、元素分析和多核磁共振(1H/31P-NMR)进行结构验证;3)X射线单晶衍射解析空间构型;4)密度泛函理论(DFT)计算与分子对接预测抗菌靶点。
【合成与表征】通过[Pd(bhquin)(μ-Cl)]2与糖精钠的甲醇反应,高效制备桥连前体1。单晶分析显示配合物2中Pd呈扭曲四方平面构型,bhquin的N原子与PPh3呈反式排列。双核配合物3-7则呈现配体依赖性构型差异:dppm/dppe/dppp构建的3-5中,一个bhquin的N原子与P原子反式配位,另一个则为C原子反式;而dppb/dppf衍生的6-7则保持N-P反式配位。
【理论计算】DFT计算揭示了配体跨度对分子几何参数的调控规律:随着双膦配体亚甲基链延长(dppm→dppb),Pd-P键长从2.283?增至2.301?,而Pd-N键长稳定在2.05?左右。这种精确的结构调控为后续功能设计提供了量化依据。
【生物活性】分子对接表明配合物可通过bhquin环插入DNA碱基对,同时sac阴离子与核糖磷酸骨架形成氢键。抗菌实验显示其对革兰氏阴性菌的抑制活性优于阳性菌,其中配合物4对大肠杆菌的MIC达32μg/mL,验证了理论预测。
这项研究通过"配体工程"策略实现了环钯化配合物的精准构筑,建立了从分子设计、结构表征到活性预测的完整研究范式。特别值得注意的是,团队发现双膦配体亚甲基数目可程序化调控分子构型,这为开发靶向性金属抗菌剂提供了新思路。论文中报道的91%高产出率合成路线,以及结合DFT与分子对接的活性预测模型,对推动功能型金属配合物的工业化应用具有重要参考价值。
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