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双探针滚环扩增-侧向层析试纸条快速检测法在卡特氏藻监测中的应用研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月19日 来源:Marine Pollution Bulletin 5.3
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针对有害藻华(HABs)中卡特氏藻(Amphidinium carterae)的监测难题,研究人员开发了双探针滚环扩增-侧向层析试纸条(dpRCA-LFD)检测技术。该技术基于ITS序列设计特异性探针,在61°C连接温度、50分钟扩增条件下,可检测低至1.3拷贝/μL的质粒DNA和单细胞样本,灵敏度较传统PCR提升100倍,且无需专业设备即可实现可视化判读,为海洋环境监测提供了高效便捷的解决方案。
海洋环境中日益频发的有害藻华(HABs)正对全球生态系统和人类健康构成严峻威胁。其中,能产生溶血毒素和雪卡毒素的卡特氏藻(Amphidinium carterae)在中国南海等海域的分布范围持续扩大,传统显微镜检测方法存在耗时长、易误判等缺陷,而现有分子检测技术又依赖昂贵仪器。针对这一技术瓶颈,哈尔滨工业大学(威海)的研究团队在《Marine Pollution Bulletin》发表创新成果,开发出双探针滚环扩增-侧向层析试纸条(dpRCA-LFD)检测体系。
研究采用双探针设计策略,短探针(SP,18nt)和长探针(LP,58nt)均经5'端磷酸化修饰,靶向卡特氏藻ITS序列,同时以秀丽隐杆线虫金属硫蛋白-2基因作为参比。关键技术包括:1)优化dpRCA反应体系(61°C连接温度+50分钟59°C扩增);2)建立LFD可视化检测流程;3)通过21种微藻对比实验验证特异性;4)采用模拟水样和自然样本进行实用性评估。
【dpRCA反应系统】
温度梯度实验显示61°C时扩增效率最高(图S1A),10次连接循环即可达到平台期。灵敏度测试表明,该方法对基因组DNA的检测下限达4.5×10?4 ng μL?1,较常规PCR提升两个数量级。
【特异性验证】
基于ITS序列设计的探针仅与卡特氏藻发生特异性反应,与20种对照藻株无交叉信号,包括形态近缘种(表S1)。
【灵敏度分析】
在重组质粒检测中,1.3拷贝/μL的检出限相当于单细胞水平。模拟水样实验证实,dpRCA-LFD可稳定检出人工添加的单个卡特氏藻细胞。
【自然样本检测】
对添加卡特氏藻的真实海水样本进行检测,成功识别目标藻细胞,验证了方法的现场适用性。
该研究突破性地将dpRCA与LFD技术整合,其创新价值体现在:1)首创双探针设计显著提升特异性,避免近缘种干扰;2)等温扩增特性摆脱对PCR仪的依赖;3)试纸条检测实现"肉眼可视"的结果判读。相比需显微镜检的传统方法和依赖精密仪器的qPCR技术,dpRCA-LFD兼具实验室精确性和现场检测便捷性,为建立有害藻类早期预警系统提供了关键技术支撑。研究获得山东省自然科学基金(ZR202204170002)等多项资助,相关成果已应用于我国南海海域的生态监测实践。
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