罕见致死性Naegleria fowleri原发性阿米巴脑膜脑炎的分子生物学与宏基因组测序联合诊断：一例儿童病例报告

本研究报道了中国首例儿童Naegleria fowleri感染致原发性阿米巴脑膜脑炎（PAM）的致死病例，通过宏基因组测序（mNGS）联合靶向PCR和碘染色镜检技术，确诊了常规方法难以识别的"食脑阿米巴"感染。研究揭示了PAM在温水性环境中的潜在传播风险，为临床早期诊断和公共卫生防控提供了关键技术路径。

　　

在温暖水域活动的儿童突发高热、呕吐伴意识障碍，短短4天内死亡——这起触目惊心的病例背后，潜藏着一个被称为"食脑阿米巴"的致命杀手：Naegleria fowleri。这种嗜热性自由生活阿米巴通过鼻腔侵入中枢神经系统（CNS），引发的原发性阿米巴脑膜脑炎（Primary amoebic meningoencephalitis, PAM）死亡率超过95%。随着全球变暖，这类罕见但凶险的感染正逐渐突破传统地理分布界限。河南省疾病预防控制中心的研究团队在《Infectious Diseases of Poverty》发表的病例研究，通过多技术联用破解了诊断难题。

研究人员采用宏基因组测序（mNGS）对脑脊液样本进行无偏性病原体筛查，发现29.4%的序列匹配N. fowleri；随后通过特异性引物PCR扩增ITS1-ITS2区域（产物大小410bp/310bp），并经碘染色镜检观察到直径15-18μm的典型阿米巴包囊，构建了从筛查到验证的完整诊断链条。

【Case presentation】部分揭示：6岁患儿在公共浴池暴露5天后发病，脑脊液检测显示乳酸（13.510 mmol/L）和神经元特异性烯醇化酶（NSE>300μg/L）显著升高。尽管联合使用两性霉素B、氟康唑和利福平治疗，仍于病程第4天死亡。

【Pathogen genomic identification】显示：mNGS获得88,932,436条原始读长，经Parasite Genome Identification Platform（PGIP）分析，50,410条读长明确指向N. fowleri。系统发育树证实其18S rRNA序列（1,843bp）与已知菌株高度同源。

【Morphological confirmation】通过碘染色镜检观察到典型包囊结构，直径15-18μm，囊壁光滑完整，为诊断提供直接形态学证据。

该研究创新性地建立了mNGS-PCR-镜检的三步诊断方案，破解了PAM诊断延迟的临床困境。其重要意义在于：①首次在中国儿童病例中完整记录N. fowleri感染诊断路径；②揭示公共洗浴设施可能成为传播媒介，拓展了传统认为的淡水暴露风险认知；③为气候变暖背景下罕见病原体监测提供技术范式。研究团队强调，对于急性脑膜脑炎伴温水暴露史患者，应尽早启动经验性抗阿米巴治疗，同时需加强人工水体卫生监管。