COVID-19大流行期间突尼斯呼吸道鼻病毒与肠道病毒的分子流行病学演变及公共卫生意义

本研究针对COVID-19非药物干预措施（NPIs）对呼吸道鼻病毒（RVs）和肠道病毒（EVs）流行特征的影响，通过分析883份鼻咽样本的RT-PCR检测及基因测序数据，首次揭示北非地区RV/EVs在疫情期间维持高基因多样性（42种基因型）的独特现象，其16.5%的检出率及RV-A（47.4%）主导的种属分布为理解非包膜病毒的抗干扰机制提供新证据。

　　

当全球目光聚焦于SARS-CoV-2时，一群"低调"的呼吸道病原体——鼻病毒(RVs)和肠道病毒(EVs)正在上演不寻常的进化故事。这些导致普通感冒的病毒虽不如新冠病毒致命，却在COVID-19大流行期间展现出惊人的适应力。尤其值得注意的是，在突尼斯这样的北非国家，严格的封锁措施虽暂时抑制了流感病毒传播，却未能阻挡RV/EVs的持续流行。这一现象引发科学界对非包膜病毒传播机制的新思考。

Habib Bourguiba大学医院微生物实验室的研究团队在《Virology》发表的重要研究，通过分析2020年10月至2022年8月收集的883份呼吸道样本，采用商业和自建RT-PCR检测结合VP4/VP2区基因测序技术，构建最大似然系统发育树并进行稀有外推分析，首次绘制了北非地区RV/EVs的分子流行病学图谱。样本来源于斯法克斯两家大学医院的住院和门诊患者，涵盖不同年龄层和临床严重程度。

【流行病学特征】
研究显示RV/EVs在疫情期间保持16.5%的稳定检出率，呈现明显的季节波动：2020年12月达峰值45.7%，2021年夏冬季出现22%的二次高峰。值得注意的是，RV-A以47.4%占比成为主导物种，其次是RV-C（29.5%）和RV-B（20.5%），而EV-B/D仅各占1.3%。儿童感染率显著高于成人（p<0.001），但临床症状严重程度无统计学差异。

【基因多样性】
通过鉴定42种RV基因型，研究发现尽管多数基因型在疫情期间呈现低水平核苷酸多态性，但与疫情前本土毒株相比仍出现明显遗传分化。稀有外推分析揭示2021年秋季至2022年夏季的基因型多样性较疫情初期（2020-2021年）显著增加，最终恢复至接近疫情前水平。系统发育分析显示部分毒株与国际流行株存在密切进化关联。

【讨论与意义】
这项研究突破性地证实：非包膜病毒对公共卫生干预措施具有独特抗性，其维持高基因多样性的能力可能源于表面蛋白的快速进化。研究首次揭示北非地区RV-C的流行优势（与欧美以RV-A为主的模式不同），为区域特异性防控提供依据。局限性在于样本量相对有限且未涵盖全部疫情阶段，但为理解病毒间竞争（viral interference）机制提供了关键数据。

该成果不仅填补了非洲呼吸道病毒基因组监测的空白，更警示学界：在关注高致病性病毒的同时，不应忽视"普通"病毒的进化潜能。随着全球进入后疫情时代，这项研究为预测呼吸道病毒传播模式转变建立了重要基线数据。