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网络毒理学联合分子对接技术探索鹅膏毒素致肝损伤的分子机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月19日 来源:Scientific Reports 3.8
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本研究针对鹅膏毒素(amatoxin)中毒高死亡率且缺乏特效疗法的临床难题,通过整合网络毒理学与分子对接技术,系统解析了SP1和CNR1核心靶点在肝损伤中的调控作用。研究人员采用ProTox-3.0和ADMETlab 2.0预测毒性特征,结合STITCH/SwissTargetPrediction靶点筛选,发现鹅膏毒素通过结合SP1(抑制RNA聚合酶II转录)和CNR1(干扰cAMP信号通路)诱发肝坏死,为开发靶向解毒剂提供了理论依据。
在自然界最致命的真菌毒素中,鹅膏毒素(amatoxin)以其惊人的热稳定性和酸耐受性著称。这种来自毒鹅膏菌(Amanita)的 bicyclic octapeptide(双环八肽)化合物,仅需0.1 mg/kg的剂量即可导致成人死亡,临床死亡率高达10-20%。中毒患者往往经历四个典型阶段:潜伏期、急性胃肠炎期、假愈期和爆发性肝衰竭期,最终因多器官功能衰竭死亡。尽管现有治疗手段包括OATP1B3转运体抑制剂、抗氧化剂等,但缺乏针对分子机制的特效疗法,肝移植仍是严重病例的唯一选择。
西南医科大学附属医院急诊医学科的研究团队在《Scientific Reports》发表的最新研究中,创新性地采用计算毒理学方法揭示了鹅膏毒素致肝损伤的分子机制。通过ProTox-3.0和ADMETlab 2.0平台预测毒性特征,结合STITCH和SwissTargetPrediction数据库筛选出11个潜在靶点,与GeneCards/OMIM/TTD数据库中的1,730个肝损伤相关基因交叉分析,最终锁定SP1(Specificity Protein 1)和CNR1(Cannabinoid Receptor 1)为核心靶标。分子对接显示鹅膏毒素与SP1(Vina评分-44.0 kcal/mol)和CNR1(-9.0 kcal/mol)具有强结合力。
关键技术包括:1)通过PubChem获取鹅膏毒素SMILES结构;2)使用STITCH/SwissTargetPrediction预测靶点;3)从GeneCards/OMIM/TTD筛选肝损伤相关基因;4)运用Cytoscape构建调控网络;5)STRING数据库进行PPI分析;6)R语言完成GO/KEGG富集分析;7)CB-Dock2平台实施分子对接。
分子结构与毒性预测
鹅膏毒素分子量902.97 Da,SMILES结构显示含12个氢键供体。ProTox-3.0预测其LD50为73 mg/kg(毒性等级3级),ADMETlab证实其具有强肝毒性和呼吸毒性。
靶点筛选与网络构建
从1,730个肝损伤基因中鉴定出SP1和CNR1为关键靶点。PPI网络显示SP1与SMAD3、TP53等节点密切关联(平均连接度11.8),CNR1则与ADCY6、GNAI2等相互作用(连接度5.24)。
功能富集分析
GO分析揭示靶点主要参与cAMP生物合成(GO:0052652)、RNA聚合酶II转录调控(GO:0061629)等过程。KEGG显示内分泌抵抗(hsa01522)和松弛素信号通路(hsa04926)是主要涉及通路。
分子对接验证
鹅膏毒素与SP1结合腔体积仅58 ?3,而与CNR1结合腔达1737 ?3,表明二者通过不同空间构象实现高亲和力结合。
该研究首次阐明鹅膏毒素通过双重机制导致肝损伤:1)SP1介导的RNA聚合酶II(RNAP II)抑制引发转录停滞;2)CNR1调控的G蛋白偶联受体信号紊乱加剧代谢异常。Chenglin Wang等提出的SP1/CNR1靶向干预策略,不仅为临床解毒剂开发指明方向,更建立了网络毒理学整合分子对接的研究范式。值得注意的是,CNR1在肝纤维化中的双向调节作用提示需精准调控其活性,而SP1抑制剂可能通过上调BCL2(B-cell lymphoma 2)减轻细胞凋亡。这些发现对其它真菌毒素中毒治疗也具有重要借鉴意义。
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