多态性对人类骨骼肌基因表达和剪接的影响:运动与饮食诱导减重干预的分子机制研究

【字体: 时间:2025年07月19日 来源:Cell Genomics 11.1

编辑推荐:

  本研究针对2型糖尿病(T2D)预防中个体对生活方式干预响应差异的遗传基础,通过16周减重干预结合骨骼肌转录组分析,揭示了东亚人群特有的e/sQTL调控网络。研究人员在54名肥胖/超重东亚个体中发现505个差异表达基因和64个差异剪接事件,鉴定出数百个生活方式响应型及亚洲特异性e/sQTL,并通过与GWAS共定位发现16个代谢风险候选基因(如DHRS4L2和ANK1),为精准化T2D防治提供了分子靶点。

  

肥胖和2型糖尿病(T2D)的全球流行凸显了生活方式干预的重要性,但个体对运动饮食干预的响应差异极大,其背后的遗传调控机制尚不明确。新加坡国立大学(National University of Singapore)的研究团队在《Cell Genomics》发表的研究,通过创新的"基因-生活方式"交互分析框架,揭示了骨骼肌在代谢调控中的核心作用。

研究采用16周标准化减重干预(平均减重8.7%),对54名东亚肥胖受试者进行配对骨骼肌活检和深度表型分析。关键技术包括:(1) InfiniumOm2-5Exome SNP芯片基因分型与千人基因组计划(1000 Genomes)数据填补;(2) 骨骼肌RNA-seq转录组与可变剪接(alternative splicing)分析;(3) RASQUAL和QTLtools进行表达/剪接数量性状位点(e/sQTL)检测;(4) COLOC方法实现e/sQTL与东亚人群GWAS的共定位分析。

主要结果

  1. 临床表型改善:干预后胰岛素敏感性指数(ISI)提升30%,肝脏脂肪减少最显著(图1B-C),118项临床指标显著改善。脂质组学显示鞘脂代谢通路变化(图1F)。

  1. 转录组重塑:505个差异基因富集于线粒体功能(如MT-ND2、MT-ATP8)和胰岛素信号通路(图2A-B)。WGCNA分析揭示线粒体电子传递链(ETC)基因共表达模块与干预效果强相关。

  1. 动态遗传调控
  • 鉴定1,217(干预前)和1,105(干预后)个eGenes,发现46个亚洲特异性eQTL(图3E)。ACTN3基因R577X突变携带者减重效果更显著(图3B)。
  • 剪接分析显示ANK1的sQTL效应在干预后减弱(图4D),其与T2D的共定位信号(PP4=0.83)随之降低。


  1. 疾病关联:共定位分析发现DHRS4L2(亚洲特异性eQTL)和ZBTB20(稳定sQTL)等16个代谢风险基因(图5A,表2)。

该研究首次系统描绘了生活方式干预下骨骼肌基因调控的动态图谱,揭示了遗传背景与减重效果的交互作用。发现的亚洲特异性e/sQTL填补了非欧人群数据的空白,而ANK1等位点效应强度的环境依赖性为"可调控遗传风险"提供了直接证据。这些发现为开发种族特异的T2D精准预防策略奠定了分子基础,也为理解运动益处的个体差异机制开辟了新视角。未来需在更大队列和女性群体中验证,并探索单细胞水平的调控异质性。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号