母体血浆中瘦素(LEP)和妊娠相关血浆蛋白A2(PAPPA2)游离RNA作为子痫前期合并胎儿生长受限的新型生物标志物研究

【字体: 时间:2025年07月19日 来源:Nature Communications 14.7

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  本研究通过大规模前瞻性队列(n=195孕妇,751份样本)结合机器学习方法,首次证实母体循环游离RNA(cfRNA)中LEP和PAPPA2可作为子痫前期(PE)合并胎儿生长受限(FGR)的强预测因子。研究发现:① 28孕周时LEP+PAPPA2组合模型的受试者工作特征曲线下面积(AUC)达0.951;② 两种cfRNA呈现显著妊娠期动态变化模式,LEP呈U型曲线而PAPPA2持续上升;③ 通过11种机器学习算法比较验证,弹性网络(Elastic net)模型最优。该成果为无创产前筛查提供了新策略。

  

研究背景与意义
子痫前期(PE)和胎儿生长受限(FGR)是困扰5-10%妊娠的严重并发症,作为"胎盘综合征"的代表性疾病,其共同病理基础在于绒毛外滋养细胞侵袭缺陷导致的胎盘血管重塑异常。虽然可溶性fms样酪氨酸激酶1(sFLT1)与胎盘生长因子(PlGF)比值已成为临床诊断PE的蛋白标志物,但游离RNA(cfRNA)因其能动态反映母体-胎盘-胎儿三方转录组特征,展现出更广阔的临床应用前景。

研究方法与设计
研究团队基于英国剑桥大学开展的妊娠结局预测(POP)前瞻性队列,精心设计了三阶段研究:发现阶段(15例PE+FGR vs 60对照)、内部验证(24例 vs 96对照)和外部验证(采用Munchel等发布的40例PE数据)。所有样本在12、20、28、36孕周(wkGA)四个时间点采集,通过定制化胎盘转录组探针进行深度测序(平均3亿reads/样本),并创新性地采用染色体Y转录本作为质控基准筛选最优生物信息学流程。

关键发现
在28wkGA发现队列中,通过四种差异表达分析方法(DESeq2、edgeR、单变量逻辑回归、AUC评估)交叉验证,最终锁定17个共享差异基因。其中LEP和PAPPA2表现尤为突出:
• LEP cfRNA呈现独特的U型变化:12wkGA高表达(中位数29 CPM)→20wkGA显著下降(5 CPM,p=5.4×10-26)→36wkGA回升至12wk水平
• PAPPA2 cfRNA持续上升:12wkGA(144 CPM)→28wkGA(373 CPM)→36wkGA达峰值(p=2.6×10-39
• 疾病组中LEP/PAPPA2表达量较对照组升高2-8倍

机器学习模型优化
研究团队系统比较了11种机器学习算法在特征选择中的表现,包括弹性网络(ENet)、LASSO、随机森林等。关键发现:
• 弹性网络以平均AUC 0.840和最小秩和胜出
• 随着预测因子数量增加,模型出现明显过拟合现象:2基因(LEP+PAPPA2)模型的LPOCV校正AUC达0.8875,而10基因模型降至0.8021
• 信息准则(AIC/BIC)分析同样支持简约模型更优

临床验证价值
在内部验证中,双基因模型展现出卓越的预测效能:
• 28wkGA样本AUC=0.800(95%CI 0.717-0.916)
• 36wkGA样本AUC进一步提升至0.807
外部验证更令人振奋,在Munchel数据集(临床确诊PE病例)中:
• LEP单指标AUC=0.942
• PAPPA2单指标AUC=0.922
• 联合模型AUC高达0.951(95%CI 0.912-0.990)

分子机制探讨
通过胎盘转录组数据库分析发现:
• PAPPA2几乎为胎盘特异性表达,提示其cfRNA升高直接反映胎盘病理状态
• LEP在胎盘、脂肪组织和乳腺中均有表达,可能参与母体代谢重编程
• 16个cfRNA(如CSHL1、CAPN6等)在健康妊娠中呈现持续上升趋势,可能作为妊娠进展的分子时钟

技术突破与优势
本研究通过三大技术创新解决领域难题:

  1. 测序深度达常规研究的15倍(3亿 vs 0.2亿reads)
  2. 引入1996个定制化胎盘转录本探针提升捕获效率
  3. 建立胎儿性别预测质控体系,筛选最优生物信息流程

临床转化前景
研究发现支持cfRNA检测可应用于:
? 高危妊娠的早期预警(20wkGA时PAPPA2已显现差异)
? 疾病严重程度评估(晚期PE中LEP异常更显著)
? 治疗靶点开发(靶向胎盘-母体通讯通路)

该研究不仅为PE/FGR的无创诊断提供新范式,更开创了通过cfRNA解析胎盘-母体对话机制的新研究方向。未来需在前瞻性临床队列中验证其预测效能,并探索LEP/PAPPA2调控网络在疾病发生中的因果作用。

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