实时逆转录PCR技术提升路毙动物样本狂犬病监测效能的创新研究

【字体: 时间:2025年07月19日 来源:PLOS Pathogens 5.5

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  本文推荐:研究证实实时逆转录PCR(RT-PCR)技术可有效检测路毙动物样本中的狂犬病病毒(RABV)RNA,突破传统抗原检测方法(DFA/DRIT)对样本质量的限制。通过对美国10州299例路毙样本(包括浣熊、臭鼬等)的LN34检测,发现2.7%阳性率,其中8例阳性样本为野生动物狂犬病管理提供了关键数据。该技术为恶劣条件下样本检测提供了新方案。

  

【引言】
在美国,每年约有9万只动物接受狂犬病检测,但传统抗原检测方法(如直接荧光抗体试验DFA和快速免疫组化试验DRIT)对样本质量要求极高。路毙动物样本因组织降解严重常被排除在检测范围外。本研究评估了实时逆转录PCR(RT-PCR)技术对路毙样本的检测效能,重点关注美国农业部野生动物服务局(USDA-WS)管理的浣熊狂犬病变异体(RRVV)疫区。

【方法】
研究收集2018-2021年间美国10个州的299例路毙样本(浣熊232例、臭鼬46例等),采用LN34泛狂犬病毒实时RT-PCR检测。建立多变量逻辑回归模型分析样本降解评分(0-1分),综合颅骨状态、脑组织状况、环境温度等参数。成本效益分析基于每样本30美元的检测预算(含20美元人工成本)。

【结果】
• 阳性检出:8例阳性(2.7%),包括7例浣熊和1例臭鼬,均为RRVV变异体。最显著案例为:

  • 弗洛伊德县浣熊:颅骨碎片中检出Ct值28.6
  • 尼亚加拉县样本:含蛆虫的油性薄膜经稀释后Ct值从37.2改善至32.5
    • 样本质量:68.9%样本因脑组织缺失/降解产生不确定结果。但3例阳性样本无可见脑组织,仅含颅腔残留物。
    • 地理分布:6例阳性位于ORV疫苗带东部(RRVV流行区),2例位于疫苗带内。
    • 成本效益:当样本降解评分>0.65时,每有效结果成本急剧上升;推荐以0.7为阈值平衡检出率与成本。

【讨论】
该研究首次系统验证RT-PCR在路毙样本检测中的优势:

  1. 技术突破:成功检测Ct值13.7-38.3的降解样本,较DFA灵敏度提升3倍
  2. 管理价值:发现8例传统方法可能漏检的阳性案例,为ORV疫苗投放提供新依据
  3. 操作规范:提出"三不采"原则——完全扁平颅骨、无结构残留物、非头部组织不采集

研究同时揭示局限性:亚利桑那州32例极端干燥样本均未检出阳性,提示沙漠环境可能加速RNA降解。未来需开发适配极端气候的稳定剂方案。

【应用前景】
作者建议将样本降解评分纳入USDA-WS监测指南:
• 优先级:疫苗带前沿区域实施0.7阈值
• 设备优化:推广使用一次性器械避免交叉污染(案例证明重复使用消毒手术刀导致假阳性)
• 技术迭代:牛津纳米孔测序已成功应用于阳性样本全基因组分析(GenBank登录号PV807767-PV807770)

该成果为全球野生动物疫病主动监测提供了可复制的技术框架,特别适用于资源有限地区的狂犬病消除计划。

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