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印度藤黄叶绿体基因组组装揭示 Garcinia 属核苷酸多样性及系统发育关系
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月20日 来源:Plant Biotechnology Reports 1.7
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来自印度的研究人员针对具有重要药用价值的濒危特有物种印度藤黄(Garcinia indica),完成了其叶绿体基因组(cp genome)的组装与分析。研究揭示了156,891 bp的典型四分体结构,发现LSC(85,580 bp)和SSC(17,181 bp)区域占64.5%,并鉴定出126个功能基因。系统发育分析表明G. indica与G. oblongifolia亲缘最近,为藤黄属物种保护与育种提供了重要分子依据。
在印度西高止山脉特有的药用树种印度藤黄(Garcinia indica)身上,科学家们解锁了其叶绿体基因组(cp genome)的完整密码。这个被称为"Kokum"的濒危物种,其果皮和种子在医药和工业领域具有重要价值。通过高通量测序技术,研究人员成功组装出156,891 bp的环状基因组,展现出经典的四分体结构——大单拷贝区(LSC)和小单拷贝区(SSC)共占64.5%,而一对27,065 bp的反向重复序列(IRA/IRB)则构成了剩余部分。
基因组图谱中,86个蛋白编码基因与40个RNA基因(含32个tRNA和8个rRNA)有序排列。更有趣的是,基于10种藤黄属植物的全基因组比较显示,G. indica与G. oblongifolia在进化树上形成了紧密的姊妹分支,这种亲缘关系远超过其与G. esculanta的联系。这项研究不仅绘制了首个印度藤黄叶绿体基因组精细图谱,更为理解该属植物的适应性进化提供了分子标记,对保护这种"植物黄金"的遗传资源具有里程碑意义。
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