后疫情时代意大利2023/2024季节呼吸道病原体流行特征及SARS-CoV-2与流感病毒分子进化研究

本研究针对意大利锡耶纳地区2023/2024季节严重急性呼吸道感染（SARI）患者，通过qRT-PCR和NGS技术系统分析了SARS-CoV-2、流感病毒（IAV/IBV）、人呼吸道合胞病毒（HRSV）等21种病原体的流行病学特征及变异规律，揭示了JN.1、EG.5等新冠变异株与6B.1A.5a.2a流感株的共流行态势，为后疫情时代呼吸道传染病防控提供重要科学依据。

　　

随着COVID-19疫情进入常态化阶段，呼吸道病原体的流行格局发生显著变化。意大利作为早期疫情暴发地区，在非药物干预措施解除后，面临SARS-CoV-2变异株与季节性流感、HRSV等病原体共循环的复杂局面。锡耶纳大学医院信托基金的研究团队在《Journal of Infection and Public Health》发表的研究，首次系统揭示了2023/2024季节意大利托斯卡纳大区呼吸道病原体的流行特征与分子进化规律。

研究团队采用多学科交叉方法，对138例SARI住院患者（平均年龄76.7岁）进行前瞻性队列研究。通过qRT-PCR检测21种呼吸道病原体，对SARS-CoV-2（Ct≤30）和流感病毒（Ct≤32）阳性样本进行全基因组测序，利用Nextclade和MEGA11进行分子进化分析。临床数据采集包括疫苗接种史、基础疾病和症状学特征。

【流行病学特征】
研究显示：1）SARS-CoV-2检出率最高（40%），主要流行株为JN.1（24A谱系）和BA.5（22B谱系）；2）流感病毒占20%，其中A(H1N1)pdm09均属6B.1A.5a.2a进化枝；3）HRSV以A亚型为主（13%）。值得注意的是，34例（24.6%）存在共感染，最常见为SARS-CoV-2与流感病毒共感染（16例）。

【病毒分子特征】
SARS-CoV-2变异株在刺突蛋白RBD区发现关键突变：JN.1.21的N405D、BA.5.3的F486P等可能增强ACE2结合力。流感病毒A(H3N2)分离株呈现双谱系分化，3C.2a1b.2a.3a.1进化枝毒株携带E50K/I140K突变，与2024/2025季疫苗株A/Thailand/8/2022高度相似。

【临床关联性】
尽管95%患者接种过COVID-19疫苗（平均3.5剂），但突破性感染普遍存在。流感疫苗接种率仅56%，且与感染风险无显著相关性（p>0.05）。基础疾病分析显示，70%患者合并心血管疾病，36%有慢性呼吸系统疾病，这些人群更易发展为重症。

该研究证实：1）后疫情时代呼吸道病毒呈现"多病原共流行"新模式；2）SARS-CoV-2变异株持续积累免疫逃逸突变；3）现有疫苗对预防重症有效但需持续更新。这些发现为优化呼吸道传染病监测策略提供了关键证据，强调需要建立整合SARS-CoV-2、流感和HRSV的多病原体监测网络。特别是发现A(H3N2)流感病毒3C.2a1b.2a.3a.1进化株的流行，直接推动了2024/2025季北半球疫苗株的更新决策。研究结果对制定老年人和慢性病患者等重点人群的免疫策略具有重要指导价值。