海岸沉积物中两株新型细菌Zhengella sedimenti与Phycobacter sedimenti的发现及其基因组与代谢特征解析

【字体: 时间:2025年07月21日 来源:Antonie van Leeuwenhoek 1.8

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  来自中国威海的研究人员从海岸沉积物中分离出两株新型革兰氏阴性菌K97T和ZM62T,通过多相分类技术结合基因组分析,分别将其命名为Phycobacter sedimenti(含DMSP合成代谢基因和完整CMP-KDO通路,提示藻类共生潜力)和Zhengella sedimenti(具有降解氨基苯甲酸(ko00627)和甲苯(ko00623)的代谢通路)。该研究为海洋微生物资源开发及生态功能研究提供新线索。

  

这项研究从中国威海海岸沉积物样本中成功分离出两株具有科学价值的新型革兰氏阴性菌。通过多相分类技术(polyphasic taxonomy)的系统分析,发现菌株K97T与Phycobacter属的P. azelaicus F10T具有98.34%的16S rRNA基因相似度,而菌株ZM62T则与Zhengella属的Z. mangrovi X9-2-2T相似度达98.53%。

两菌株均以泛醌Q-10(ubiquinone Q-10)作为呼吸链组分,主要脂肪酸为Summed Feature 8(C18:1ω6c/C18:1ω7c)。极性脂质分析显示,K97T含二磷脂酰甘油(DPG)、磷脂酰乙醇胺(PE)和磷脂酰甘油(PG),而ZM62T额外含有磷脂酰胆碱(PC)。

基因组分析揭示Phycobacter属菌株具有二甲基巯基丙酸(DMSP)合成代谢基因和完整的CMP-酮脱氧辛酸(CMP-KDO)通路,暗示其与藻类存在潜在共生关系。ZM62T则携带氨基苯甲酸(aminobenzoate)和甲苯(toluene)降解通路基因,展现环境污染物降解潜力。

基于上述特征,研究者将K97T命名为Phycobacter sedimenti sp. nov.(模式菌株KCTC 8365T/MCCC 1H01460T),ZM62T命名为Zhengella sedimenti sp. nov.(模式菌株KCTC 8813T/MCCC 1H01495T),为海洋微生物分类学和生态功能研究提供了重要参考。

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