天然产物诱导神经母细胞瘤焦亡的发现:计算模拟与实验验证揭示姜黄素双重调控机制

【字体: 时间:2025年07月21日 来源:BMC Complementary Medicine and Therapies 3.3

编辑推荐:

  本研究针对神经母细胞瘤凋亡逃逸难题,通过计算模拟筛选靶向gasdermin D(GSDMD)寡聚化的天然产物,实验验证姜黄素(curcumin)可同时激活caspase-1介导的焦亡(pyroptosis)和caspase-3介导的凋亡(apoptosis),为开发新型抗肿瘤策略提供双重作用机制候选药物。

  

神经母细胞瘤作为儿童最常见的颅外实体肿瘤,其治疗面临严峻挑战——肿瘤细胞通过癌基因突变和抗凋亡蛋白的过表达,能够巧妙规避传统凋亡诱导剂的杀伤。这种"狡诈"的生存策略使得临床亟需开发能协同其他细胞死亡机制的新型治疗方案。在众多候选机制中,焦亡(pyroptosis)这种由炎症小体激活的细胞死亡方式崭露头角,其独特的gasdermin D(GSDMD)蛋白寡聚化形成膜孔的特性,为肿瘤治疗提供了新思路。然而,如何精准调控这一过程仍是未解之谜。

针对这一科学难题,印度尼西亚加查马达大学(Universitas Gadjah Mada)的研究团队开展了一项创新研究。研究人员采用"计算模拟指导实验验证"的策略,从40余万种天然产物中筛选出能调控GSDMD寡聚化的活性成分,最终发现姜黄素(curcumin)具有同时诱导凋亡和焦亡的双重功效。这项突破性成果发表在《BMC Complementary Medicine and Therapies》期刊,为神经母细胞瘤治疗提供了多靶点干预的新范式。

研究团队运用四大关键技术方法:1)基于COCONUT数据库的虚拟筛选,通过Lipinski五规则和药效团模型初筛候选化合物;2)分子对接(MOE软件)和分子动力学模拟(NAMD 2.14)预测化合物与GSDMD二聚体的相互作用;3)细胞毒性检测(WST-8法)评估化合物对SK-N-AS神经母细胞瘤细胞的杀伤效应;4)免疫荧光和Western blot分析caspase-1/-3激活等细胞死亡标志物。

【药物相似性分析与药效团筛选】
研究团队从COCONUT数据库获取407,270种天然化合物,经Lipinski五规则筛选获得233,587个候选分子。通过分析GSDMD C端自抑制结构域(CTD)的关键氨基酸残基(Leu292、Glu295等),构建包含两个氧原子受体的药效团模型,最终筛选出槲皮素(quercetin)、柚皮素(naringenin)等10个候选化合物。PMI分析显示这些化合物多具有盘状支架结构,适合干预蛋白质-蛋白质相互作用。

【分子对接与动力学模拟】
采用MOE软件对GSDMD二聚体(PDB 6VFE)进行分子对接,发现槲皮素(-9.27 kcal/mol)和姜黄素(-8.34 kcal/mol)等五种化合物结合能优于阳性对照metatinib(-7.28 kcal/mol)。10 ns分子动力学模拟显示,姜黄素能显著稳定GSDMD二聚体结构,使RMSD值降低、Rg值更紧凑。MM-GBSA计算证实柚皮素(ΔGbind=-16.968 kcal/mol)和姜黄素(ΔGbind=-13.508 kcal/mol)具有最优结合自由能。

【细胞毒性效应验证】
在SK-N-AS细胞系中,姜黄素展现最强细胞毒性(IC50=21 μM),其次是槲皮素(37 μM)和高良姜素(galangin,49 μM)。Western blot分析揭示姜黄素和槲皮素可促进caspase-3剪切,同时降低procaspase-7/8水平;而高良姜素则呈现独特的procaspase-7/8上调模式。

【焦亡特异性检测】
通过FLICA荧光探针标记active caspase-1发现,姜黄素处理组出现线粒体周围特异性荧光聚集,高良姜素组则呈现全胞质均匀分布,二者均显著强于阳性对照nigericin。这证实姜黄素和高良姜素可通过不同途径激活caspase-1诱导焦亡,其中姜黄素还能协同激活凋亡通路。

这项研究通过多学科交叉方法,首次系统阐释了天然产物调控神经母细胞瘤焦亡的分子机制。特别值得注意的是,姜黄素展现出"一箭双雕"的治疗潜力——既能通过稳定GSDMD寡聚体促进焦亡,又可激活经典凋亡通路。这种双重作用机制有效规避了肿瘤细胞对单一死亡途径的抵抗,为克服化疗耐药提供了新思路。研究还揭示高良姜素作为选择性焦亡诱导剂的独特价值,为开发靶向性更强的抗肿瘤药物奠定基础。

从转化医学角度看,该研究建立的"计算筛选-动力学模拟-实验验证"研究范式,显著提高了天然产物药物开发的效率。发现的候选化合物如姜黄素已有长期临床应用史,其安全性特征有望加速临床转化进程。未来研究可进一步探索这些化合物与现有化疗方案的协同效应,以及其对肿瘤微环境免疫调控的影响,为神经母细胞瘤的联合治疗提供更全面的科学依据。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号