循环T细胞受体组库分析:提升早期癌症检测灵敏度的创新液体活检技术

【字体: 时间:2025年07月21日 来源:npj Precision Oncology 6.8

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  这篇研究通过深度测序循环T细胞受体(TCR)β链,构建了基于序列相似性的TCR功能单元(RFU),并利用机器学习模型在463例肺癌患者和587例对照中鉴定出327个癌症相关RFU。该技术联合ctDNA和蛋白标志物,将I期肺癌检测灵敏度提升至50%(特异性80%),揭示了TCR组库在液体活检中的互补价值,为早期癌症筛查提供了新策略。

  

循环T细胞受体组库助力癌症早期检测

引言
肺癌早期诊断面临巨大挑战,尽管低剂量CT(LDCT)筛查可降低死亡率,但现有血液标志物如ctDNA对早期肺癌灵敏度不足20%。研究团队另辟蹊径,利用T细胞对肿瘤抗原的特异性识别,通过测序外周血TCRβ链,探索免疫应答信号在癌症早诊中的价值。

研究方法与队列设计
研究纳入463例肺癌患者(86%为I期)和587例健康对照,从血沉棕黄层提取gDNA进行TCR测序,中位深度达113,571克隆型/样本。通过改进的密度峰值聚类算法(CFSFDP),将TCR按CDR3序列相似性聚类为功能单元(RFU),并建立支持向量机(SVM)模型评估癌症预测效能。

关键发现

  1. 癌症相关RFU特征:在8种不同距离阈值(dc)下,共发现327个FDR≤0.1的癌症相关RFU,其中157个在癌组富集(倍数变化1.03-2.26),170个在对照组富集(最高达17.2倍)。
  2. HLA限制性:76%的RFU与特定HLA等位基因相关,且92%关联信号来自II类HLA(如DRB1、DQB1),提示CD4+ T细胞应答的主导作用。
  3. 跨平台验证:单细胞测序显示,部分RFU TCR能与肿瘤抗原(如MAGE蛋白)结合,且黏膜相关恒定T细胞(MAIT)可能参与抗肿瘤响应。

临床应用价值

  • 灵敏度突破:RFU模型在80%特异性下可检出48%的I期肺癌,显著优于ctDNA(20%)。
  • 多组学整合:联合ctDNA(靶向154个驱动基因)和17种蛋白标志物,早期肺癌检测灵敏度提升20个百分点。
  • 生物学意义:免疫编辑理论可解释为何早期与晚期癌症的RFU信号强度相似——免疫系统在肿瘤消除阶段已产生强烈应答。

技术优势与局限
研究创新性地将TCR序列相似性转化为可量化的RFU特征,但存在样本采集偏倚(部分对照未经CT确认)及TCRα链数据缺失等问题。未来需在前瞻性队列中验证RFU的预测效能。

展望
该技术可直接整合至现有液体活检流程,利用常规血液检测的剩余血沉棕黄层,为多癌种早筛提供新思路。进一步探索RFU靶向抗原及CD4+/CD8+ T细胞协同机制,将推动个性化免疫监测发展。

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