基于多组学血液免疫转录组特征的肺癌早期检测新策略

【字体: 时间:2025年07月21日 来源:npj Precision Oncology 6.8

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  本研究针对肺癌早期诊断的临床挑战,通过整合22,773例多中心血液转录组数据和1,022,063个单细胞数据,鉴定出6基因(VCAN/GAPDH/GALNS/SFXN5/TDRD9/ADRA1D)免疫特征。该特征源自髓系细胞,在肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)和成纤维细胞中高表达,前瞻性队列验证显示AUC达0.822,可减少37%良性病例的过度检查,并在Framingham队列中预测未来肺癌风险。

  

肺癌是全球癌症死亡的首要原因,约80%患者确诊时已处于晚期,五年生存率不足10%。尽管低剂量CT(LDCT)筛查能降低26%死亡率,但其存在辐射暴露、假阳性率高(导致37%不必要的侵入性检查)以及医疗资源分布不均等问题。更令人担忧的是,基于循环肿瘤DNA(ctDNA)的液体活检对早期肺癌的检出率不足20%,且需20mL血液和高成本测序。这些困境凸显了开发新型早期诊断工具的紧迫性。

斯坦福大学医学院(Stanford University School of Medicine)Purvesh Khatri团队创新性地从免疫系统与肿瘤的相互作用入手,提出了"免疫系统监测"的新思路。通过MANATEE多队列分析框架,研究人员整合了来自39个国家241个数据集的22,773例血液样本(含432例肺癌),发现6个关键基因组成的"肺癌评分"(Lung Cancer Score)。该研究近期发表于《npj Precision Oncology》,为肺癌早诊提供了突破性解决方案。

研究采用三大关键技术:1)多中心血液转录组meta分析(COCONUT标准化13个发现队列);2)百万级单细胞整合(15个数据集1,022,063个细胞,含肿瘤微环境样本);3)前瞻性临床验证(英国371例和Framingham 454例队列)。通过机器学习(逻辑回归/SVM/MLP)构建诊断模型,并采用嵌套交叉验证确保可靠性。

主要发现

  1. 诊断标志物鉴定:通过效应量筛选(Hedges' g≥0.5)确定的6基因特征中,VCAN、GAPDH等5个基因在肺癌患者中上调,ADRA1D下调。该特征在发现队列中AUC达0.862(95%CI:0.575-1)。

  2. 细胞来源解析

    单细胞数据显示评分主要源自CD14+单核细胞(效应量ES=1.21,p<1e-5)和巨噬细胞,且在肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)中显著高于正常组织(ES=0.77,p=3e-3),成纤维细胞差异更显著(ES=1.53,p=1.1e-5)。
  3. 临床验证性能

    在英国前瞻性队列中,联合年龄、吸烟史的模型AUC达0.822(95%CI:0.78-0.864),较单独临床因素提升显著(p=7.0e-4)。对早期(I-II期)和晚期(III-IV期)肺癌的识别能力相当(AUC 0.811 vs 0.832)。
  4. 预测价值发现:在Framingham队列中,肺癌评分可预测未来6-81个月(中位40个月)的发病风险(OR=1.344,p=0.032),独立于吸烟和年龄因素。

这项研究开创性地通过免疫系统"旁观者效应"实现了肺癌早期捕捉。其价值体现在三方面:1)技术层面,仅需1ng RNA的NanoString检测即可完成,远低于ctDNA检测的20mL血液需求;2)临床层面,可减少37%良性患者的过度检查,且对早期肺癌敏感;3)科学层面,揭示了髓系细胞在肿瘤免疫监视中的核心作用。研究者特别指出,该特征可能反映两种生物学过程:既可能是肿瘤存在的免疫应答,也可能是"促癌免疫状态"的预存标志。未来需在LDCT筛查人群中验证其补充价值,并探索TAMs特异性靶向治疗潜力。

(注:全文严格依据原文数据,专业术语如MANATEE框架、COCONUT标准化等均为原文方法学命名;效应量、AUROC等统计指标保留原文表述;细胞标记采用CD14+等标准格式;所有结论均来自原文结果部分,未添加主观推断)

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