基于多组学整合分析的先天性糖基化障碍共性治疗靶点预测研究

【字体: 时间:2025年07月21日 来源:Molecular Genetics and Metabolism 3.7

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  本研究针对190余种先天性糖基化障碍(CDG)缺乏共性治疗策略的难题,通过整合PMM2-CDG等6种CDG的RNA测序、蛋白质组与糖蛋白质组数据,首次发现LRP1等4种糖蛋白的异常糖基化及自噬-线粒体通路紊乱是跨CDG类型的共同特征,并利用EMUDRA算法预测出肌肉松弛剂、抗氧化剂等5类可靶向纠正这些异常的候选药物,为CDG的广谱治疗开发提供新思路。

  

先天性糖基化障碍(CDG)是一组由糖基化缺陷引发的遗传代谢病,涉及190多个基因变异,临床表现高度异质性。尽管超过50%的人类蛋白质需要糖基化修饰维持功能,但目前除少数CDG可通过单糖补充治疗外,绝大多数缺乏有效疗法。传统针对单一基因缺陷的研发模式面临模型构建耗时、成本高昂等瓶颈,亟需寻找跨CDG类型的共性治疗靶点。

美国国立神经疾病与卒中研究所(NINDS)等机构资助的研究团队在《Molecular Genetics and Metabolism》发表突破性成果。研究人员创新性地整合6种CDG(PMM2-CDG、ALG1-CDG、SRD5A3-CDG、NGLY1-CDDG、ALG13-CDG和PGM1-CDG)的多组学数据,涵盖人类皮质类器官、诱导心肌细胞等模型。通过差异表达分析、糖基化位点鉴定及GSEA通路富集,结合EMUDRA药物预测算法,系统揭示了CDG的共性分子机制与潜在治疗策略。

关键技术包括:1) 整合8个公共糖蛋白质组数据集分析异常糖基化模式;2) 采用Gene Set Enrichment Analysis(GSEA)鉴定跨CDG的失调通路;3) 应用EMUDRA算法从FDA批准药物库中预测候选化合物。

【Results】部分发现:1) 糖蛋白异常:LRP1、LAMP1、HYOU1和APMAP在全部数据集呈现一致性糖基化改变,涉及6个保守糖基化位点;2) 通路共性:自噬障碍、囊泡运输异常和线粒体功能受损是CDG的三大共享特征;3) 药物预测:肌肉松弛剂、β肾上腺素激动剂等5类药物可逆转核心通路异常,尤其对N-糖基化和自噬调节作用显著。

【Discussion】指出该研究首次证实不同CDG存在共性的糖蛋白修饰异常和细胞器功能障碍,突破传统"单基因单治疗"研发范式。预测的抗氧化剂等现有药物可直接进入临床验证阶段,大幅缩短研发周期。特别值得注意的是,LRP1等糖蛋白作为跨组织表达的枢纽分子,其异常糖基化可能通过影响细胞信号传导加剧表型异质性,这为理解CDG复杂临床表现提供了新视角。

这项研究开创了基于多组学数据挖掘罕见病共性治疗靶点的新范式,不仅为CDG药物开发指明方向,其整合分析方法也可推广至其他遗传代谢病领域。未来需在患者源性细胞模型中对预测药物进行功能验证,并探索糖基化-自噬-线粒体轴在疾病进展中的动态调控机制。

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