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"Aneogmena fischeri线粒体基因组测序与系统发育分析揭示寄蝇科(Tachinidae)Goniini族的进化关系"
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月21日 来源:Mitochondrial DNA Part B 0.5
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本研究首次完成寄蝇科Goniini族模式种Aneogmena fischeri线粒体基因组(15,411 bp)测序,揭示其高AT偏好性(80.95%)及典型基因排列特征。通过76个近缘物种系统发育分析,证实A. fischeri与Blepharipa属形成姐妹群关系,并发现Eryciini族的多系性现象,为寄蝇科(Tachinidae)亚科级分类修订提供重要分子证据。
寄蝇科(Tachinidae)昆虫作为重要的天敌资源,其分类学研究长期依赖形态特征。Aneogmena fischeri作为Goniini族的模式种,在东方区广泛分布,其成虫具有眼裸、小盾片交叉端鬃等典型特征。由于Exoristinae亚科内Goniini与Eryciini两族形态高度相似,目前全球仅10个Goniini族和14个Eryciini族物种完成线粒体基因组测序,制约了分子系统学研究进展。
标本采自贵州花江镇(北纬25°44′57″,东经105°36′24″),采用Illumina NovaSeq 6000平台进行150 bp双端测序。通过MitoZ软件组装,Geneious Prime和MITOS联合注释,使用MAFFT进行多序列比对,基于13个蛋白编码基因(PCGs)构建最大似然树(ML),采用GTR+I+G模型进行10,000次自举检验。
线粒体基因组特征
A. fischeri环状线粒体基因组(OR537869)含13个PCGs、22个tRNAs、2个rRNAs和1个控制区(CR)。基因排列与Exoristinae亚科其他物种一致,AT含量高达80.95%(A:41.01%, T:39.94%)。ND5(1,735 bp)为最长PCG,ATP8(162 bp)最短。COI以CAA起始,ND1以TTG起始,7个PCGs采用ATG起始密码子。
系统发育分析
ML树显示:1)A. fischeri与Blepharipa属构成单系群;2)Exoristinae亚科呈现明显单系性;3)Goniini族整体为单系群,但Exorista civilis出现异常聚类;4)Eryciini族呈现多系性,部分成员与Winthemiini或Blondeliini族混杂。
该研究首次揭示A. fischeri线粒体基因组中COI基因的非典型起始密码子(CAA)现象,其与Blepharipa属的姐妹群关系支持了形态学分类框架。Eryciini族的多系性结果与Blaschke等(2018)基于多基因的研究相符,暗示现行分类系统需修订。值得注意的是,Exorista civilis的异常聚类可能反映水平基因转移事件或分类错误,建议结合形态-分子数据重新评估其分类地位。
研究涉及物种未列入中国保护动物名录,标本采集获贵州医科大学批准。原始数据已存入NCBI(BioProject: PRJNA1056650),为后续比较基因组学研究提供重要基础。
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