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亚微米红外光谱技术揭示产脂酵母单细胞表型多样性及其在微生物油脂生产优化中的应用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月22日 来源:Microbial Cell Factories 4.3
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本研究针对微生物油脂生产过程中表型多样性导致的代谢异质性问题,采用光学光热红外光谱(O-PTIR)技术,首次实现了产脂酵母Rhodotorula graminis单细胞水平的三酰甘油(TAGs)与游离脂肪酸(FFAs)的精准区分,揭示了细胞尺寸依赖的化学组成差异,为工业发酵过程优化提供了新工具。
在追求可持续发展的浪潮中,微生物油脂生产被视为替代化石燃料和化工原料的绿色解决方案。然而,生物反应器中微小的环境梯度与细胞周期差异,往往导致微生物群体出现"表型马赛克"现象——就像同一片森林中的树木因光照差异长势迥异,单个酵母细胞的代谢活动也会产生显著分化。这种异质性直接影响三酰甘油(TAGs)和游离脂肪酸(FFAs)等目标产物的产出效率,但传统流式细胞术因缺乏特异性荧光标记,难以区分这两种关键脂类。
挪威生命科学大学(Norwegian University of Life Sciences)的Uladzislau Blazhko团队在《Microbial Cell Factories》发表的研究,如同给微生物世界装上了"化学显微镜"。他们采用革命性的光学光热红外光谱(O-PTIR)技术,以亚微米级分辨率扫描了40个R. graminis酵母细胞(每个细胞6个测量点),结合傅里叶变换红外光谱(FTIR)的体相数据,构建了单细胞化学图谱。通过创新性地选取1748 cm-1(TAGs)、1714 cm-1(FFAs)和1659 cm-1(蛋白质)等特征波数,实现了"四波长快速扫描"策略,将复杂代谢表型转化为可量化的光谱指纹。
关键技术包括:1) O-PTIR单细胞光谱采集(空间分辨率416 nm);2) 细胞尺寸图像分析系统;3) 主成分分析(PCA)化学特征提取;4) 稀疏波长采集模拟实验。这些方法如同组合拳,突破了传统红外光谱的衍射极限。
【细胞化学变异性评估】

研究发现群体中存在"化学离群者"——约5%细胞的化学组成显著偏离群体均值(Pearson距离>0.2)。更有趣的是,单个酵母内部也存在"化学地理差异",某些细胞的胞内变异度甚至超过群体差异,这可能是脂质体与细胞质区域化分布的结果。
【尺寸依赖的代谢策略】

将细胞按截面积分为三组后揭示:
小型细胞(<6 μm2)是"蛋白质工厂",蛋白信号强度比大中型细胞高23%
中型细胞(6-12 μm2)展现"FFAs蓄水池"特性,1714 cm-1/1748 cm-1比值达1.8
大型细胞(>12 μm2)转型为"TAGs仓库",TAGs/FFAs比值较中型细胞提升300%
【稀疏波长扫描可行性验证】

仅用1800 cm-1(基线)、1748 cm-1(TAGs)、1714 cm-1(FFAs)和1659 cm-1(蛋白质)四个波数采集数据,仍能保持88%的化学区分效能,为高通量检测铺平道路。
这项研究犹如打开了微生物发酵过程的"黑箱",其突破性在于:1) 首次实现酵母单细胞TAGs/FFAs原位区分;2) 建立细胞尺寸-代谢表型的定量关系;3) 开发适用于工业监测的快速检测方案。未来结合自动化采样与计算机视觉,该技术有望成为生物反应器的"代谢雷达",实时捕捉群体异质性动态,为精准调控发酵工艺提供分子导航。正如作者Boris Zimmermann所述:"理解单细胞化学多样性,是驾驭微生物群体的关键钥匙。"
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