基于机器学习的STAT3靶点发现:温胃散积方治疗慢性萎缩性胃炎的多组学机制研究

【字体: 时间:2025年07月22日 来源:Pharmacological Research - Modern Chinese Medicine CS3.4

编辑推荐:

  针对慢性萎缩性胃炎(CAG)癌变风险高、西医疗效有限的问题,西安交通大学团队通过网络药理学结合机器学习(PCA/LASSO/RF)筛选温胃散积方(WWSJ)53种活性成分,发现其通过抑制STAT3磷酸化(Tyr705)调控JAK-STAT通路,实验证实可下调BCL2/MMP9等癌基因表达,为中药复方多靶点治疗提供新证据。

  

慢性萎缩性胃炎(CAG)作为胃癌发生的关键癌前病变,全球患病率高达25%,中国患者癌变风险尤为突出。当前西医治疗以幽门螺杆菌(Hp)根除和抑酸为主,但对肠上皮化生等病理逆转效果有限。传统中药复方凭借"异病同治"理念展现独特优势,其中温胃散积方(WWSJ)由红参、檀香、干姜等9味药材组成,临床证实可改善胃黏膜炎症,但其分子机制尚未阐明。

西安交通大学医学院的研究团队在《Pharmacological Research - Modern Chinese Medicine》发表创新研究,首次通过机器学习驱动的多组学策略揭示WWSJ治疗CAG的核心靶点。研究人员整合TCMSP/SymMap数据库筛选53种活性成分(口服生物利用度OB≥30%,类药性DL≥0.1),结合GEO数据库GSE55696数据集,采用主成分分析(PCA)、最小绝对收缩选择算子(LASSO)和随机森林(RF)三重算法筛选关键靶点,并通过AutoDock Vina进行分子对接验证。细胞实验采用MNNG诱导的人胃黏膜上皮细胞(GES-1)模型,动物实验建立SD大鼠6个月CAG模型,通过Western blot、qRT-PCR等技术验证机制。

研究结果揭示:

  1. 活性成分与靶点网络:鉴定出槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇等5种核心成分,其中β-谷甾醇与STAT3结合能达-9.2 kcal/mol。
  2. 机器学习筛选:GRIN2A(PC1载荷值0.83)和USP10(系数0.35)等基因与STAT3存在显著共表达(r=0.42)。
  3. 通路分析:JAK-STAT信号通路富集最显著,涉及BCL2、MMP9等10个下游靶基因。
  4. 实验验证:WWSJ使MNNG-GES-1细胞存活率降低47%,大鼠胃组织p-STAT3(Tyr705)磷酸化水平下降62%,同时PGI/GAS-17等血清标志物显著改善。

讨论部分指出,该研究创新性地建立"降维-特征选择-非线性建模"计算生物学框架,证实WWSJ通过多组分协同抑制STAT3信号转导:β-谷甾醇直接结合STAT3的Lys-90/Asp-91位点;木犀草素增强STAT3-SHP-1结合;USP10通过去泛素化稳定STAT3蛋白。这种"中药-成分-靶点-通路"多维调控模式,为中药复方系统药理研究提供范式。

该研究的临床意义在于:①首次明确STAT3是WWSJ治疗CAG的核心靶标;②发现β-谷甾醇等成分具有STAT3变构抑制潜力;③为CAG的癌变阻断提供精准治疗策略。未来需开展临床样本验证,并探索STAT3与铁死亡等新型细胞死亡途径的关联。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号