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靶向细胞类型的网络校正联合疗法:基于转录组学和真实世界证据的阿尔茨海默病治疗新策略
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月22日 来源:Cell 45.5
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针对阿尔茨海默病(AD)的细胞异质性和治疗瓶颈,研究人员通过整合单细胞转录组学(snRNA-seq)、药物重定位数据库(CMap)和电子病历(EMR)数据,发现来曲唑(letrozole)与伊立替康(irinotecan)联合疗法可特异性逆转神经元和胶质细胞的AD相关基因网络,在5xFAD/PS19小鼠模型中显著改善记忆缺陷并减少Aβ斑块和tau病理。该研究为多靶点组合疗法开发提供了创新范式。
阿尔茨海默病(AD)作为最普遍的神经退行性疾病,全球患者已超5000万,但药物研发失败率高达98%。现有疗法多靶向单一病理特征如Aβ斑块或tau蛋白缠结,却忽视了疾病进程中神经元与胶质细胞复杂的互作网络。这种"单靶点"策略难以应对AD的细胞异质性——近期单细胞研究揭示,不同脑细胞类型在AD中呈现独特的基因表达谱,甚至同一基因(如APOE)在不同细胞中呈现相反调控模式。更棘手的是,传统药物筛选模型无法反映人类患者的真实响应,导致大量临床前成果难以转化。
针对这些挑战,加州大学旧金山分校(University of California, San Francisco)与格拉德斯通研究所(Gladstone Institutes)的研究团队开创性地将人类多组学数据与真实世界证据相结合,开发出"细胞类型导向的网络校正疗法"。研究人员首先整合了三项独立研究的死后脑组织单核RNA测序(snRNA-seq)数据,涵盖47例AD患者和44例对照,通过计算校正批次效应后,系统分析了兴奋性神经元、抑制性神经元、小胶质细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞及其前体细胞等六类细胞的差异表达基因(DEG)。发现AD相关通路具有显著细胞特异性:如神经元中突触活动相关通路异常,而胶质细胞中胆固醇代谢和氧化磷酸化通路紊乱。
为寻找能逆转这些异常的药物,团队将细胞类型特异性DEG谱与 Connectivity Map(CMap)数据库匹配,筛选出86个候选药物,其中25个能同时调控多类细胞。通过分析加州大学系统1000万份电子病历(EMR),发现乳腺癌药物来曲唑(靶向神经元)和结肠癌药物伊立替康(靶向胶质细胞)暴露人群的AD风险显著降低(相对风险分别为0.466和0.195)。基于此,研究人员在5xFAD/PS19双转基因小鼠(同时存在Aβ和tau病理)中验证了该联合疗法的效果。
研究主要采用四大关键技术:(1)多中心snRNA-seq数据整合与细胞通讯网络分析;(2)基于CMap数据库的计算机药物重定位;(3)UC系统EMR的倾向评分匹配分析;(4)AD小鼠模型的行为学与病理评估。
单细胞转录组揭示AD细胞异质性
通过整合Mathys、Zhou和Lau三个团队的snRNA-seq数据,研究发现抑制性神经元在AD中比例显著降低,且细胞间通讯(CCC)模式改变:所有细胞类型对抑制性神经元的信号传递增强,而对兴奋性神经元的信号减弱。差异表达分析显示APOE在AD小胶质细胞中上调,却在星形胶质细胞和少突胶质前体细胞中下调,凸显病理机制的复杂性。
计算药物重定位与临床验证
针对神经元异常,来曲唑在CMap中显示出对兴奋性(逆转评分-0.37)和抑制性神经元(-0.61)基因谱的显著校正作用;伊立替康则对星形胶质细胞(-0.29)、小胶质细胞(-0.31)和少突胶质前体细胞(-0.45)有调控效果。EMR分析证实,使用这两种药物的癌症患者AD发病率降低超过50%,且匹配后混杂因素影响可控(标准化均值差<0.1)。
动物实验验证治疗潜力
在5xFAD/PS19小鼠中,联合治疗组在Morris水迷宫测试中表现出独特的空间记忆改善:24小时和72小时探针测试中,仅联合组对目标象限的偏好显著高于对照组(p<0.05)。病理分析显示联合治疗使海马体积增加15%,Aβ斑块减少40%,磷酸化tau(AT8+)面积减少25%,并显著缓解小胶质细胞活化(Iba1+面积减少30%)。单细胞测序证实治疗逆转了AD相关基因网络,如神经元中突触相关基因(SNAP25、NRGN)和胶质细胞中APOE的表达异常。
这项研究的重要意义在于:首次实现从人类数据驱动到动物验证的闭环研究范式,突破传统AD药物开发的"神经元中心论",证实同时靶向神经元和胶质细胞的必要性。临床转化优势显著——来曲唑和伊立替康均为已批准药物,且能透过血脑屏障。研究建立的"计算预测-临床验证-机制解析"框架,为其他复杂疾病治疗提供了可借鉴的路线图。正如作者Yadong Huang所述:"这种细胞类型导向的组合疗法,为基于患者特异性分子特征的精准医疗奠定了基础。"
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