珊瑚弧菌(Vibrio coralliilyticus)ATCC BAA-450和OCN014菌株全基因组测序揭示海洋病原体进化与致病机制

来自美国国家科学基金会资助团队的研究人员完成了珊瑚弧菌(Vibrio coralliilyticus)两种致病菌株ATCC BAA-450和OCN014的全基因组测序，分别获得3.48 Mb/1.89 Mb/381.33 kb和3.44 Mb/1.86 Mb/397.48 kb的染色体与质粒序列。该研究采用Oxford Nanopore(ONT)R10.4.1测序技术结合Flye v2.9组装，为解析该海洋病原体宿主特异性致病机制提供关键基因组资源。

　　

这项研究公布了两种珊瑚致病菌——珊瑚弧菌(Vibrio coralliilyticus)ATCC BAA-450和OCN014菌株的完整基因组图谱。前者分离自非洲桑给巴尔群岛的疣状杯形珊瑚(Pocillopora damicornis)，后者源自太平洋帕尔米拉环礁的桌形轴孔珊瑚(Acropora cytherea)。

研究团队采用突破性的纳米孔测序技术(Oxford Nanopore)，通过PromethION P24平台获取长读长数据，最长读长达65,347bp。经Flye基因组组装和Medaka抛光，最终获得BAA-450菌株5.7Mb基因组（含3.48Mb染色体1、1.89Mb染色体2和381kb大质粒pVC450），以及OCN014菌株5.76Mb基因组（含3.44Mb染色体1、1.86Mb染色体2和397kb质粒pVC14）。

值得注意的是，这些菌株展现出45.5%-46%的GC含量特征，通过nucmer比对证实了基因组环状结构。研究还采用Bakta注释系统鉴定出5,302-5,377个编码基因，为揭示其温度依赖性毒力调控等致病机制奠定基础。

该基因组资源将推动珊瑚白化等海洋疾病研究，特别有助于理解革兰氏阴性菌(III型分泌系统)等毒力因子在造礁珊瑚-微生物互作中的分子机制。所有数据已提交NCBI数据库（项目号PRJNA1105701），为全球海洋生态保护提供重要科学依据。