降解菌与非降解菌互作稳定天然生物聚合物降解群落功能的机制研究

【字体: 时间:2025年07月22日 来源:Proceedings of the National Academy of Sciences 9.4

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  针对生物聚合物降解过程中非降解菌作用机制不明的科学问题,研究人员通过解析EMSD5木质纤维素降解菌群发现,非降解菌(如大肠杆菌E. coli)通过创造厌氧环境和提供生物素(biotin)扩展降解菌(如Lachnoclostridium sp.和丙酮丁醇梭菌C. beijerinckii)生态位。研究揭示了寡糖资源分配和糖苷酶(glycosidase)分泌调控的双重限制机制,并据此构建了无需预厌氧处理即可将半纤维素(hemicellulose)转化为异丙醇(isopropanol)的合成菌群,为天然降解群落的稳定互作机制和生物转化应用提供了新见解。

  自然界中,生物聚合物(biopolymer)降解菌群是驱动碳生物地球化学循环的关键引擎。这些群落里,降解菌通过分泌胞外酶将大分子聚合物"拆解"成小分子"食物",供养着非降解菌的生长。但科学界一直困惑:非降解菌究竟扮演什么角色?降解菌又如何防止自己的劳动成果被"搭便车"?

最新研究揭开了这个微生物社会的精妙平衡。以玉米芯为"餐桌"的EMSD5降解菌群中,大肠杆菌(Escherichia coli)这类非降解菌竟是"贴心管家"——它们通过消耗氧气创造厌氧环境,还分泌维生素H(biotin),为真正的主力降解菌(如毛螺菌属Lachnoclostridium sp.和拜氏梭菌Clostridium beijerinckii)打造舒适的工作环境。

更有趣的是,降解过程像精心设计的"流水线":Lachnoclostridium先将木质纤维素(lignocellulose)分解成寡糖(oligosaccharides),但这些"半成品"被分子结构"加密",E. coli根本无法享用。接着C. beijerinckii接手加工,将部分寡糖转化为单糖(monosaccharides)供养E. coli。研究还发现,共培养时C. beijerinckii会聪明地减少糖苷酶(glycosidase)分泌,避免"食物"被过度瓜分。

基于这些发现,科学家玩起了"微生物乐高"——将来自不可培养Lachnoclostridium的木聚糖酶(xylanase)基因植入E. coli,与C. beijerinckii组队。这个"超级工程菌群"成功跳过了传统厌氧预处理步骤,直接把半纤维素(hemicellulose)变成了异丙醇(isopropanol)。这项研究不仅揭示了微生物界"我为人人,人人为我"的生存智慧,更为开发生物能源和碳循环调控提供了新思路。

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