两株PRRSV弱毒疫苗重组毒株的 emergence 及其在种猪群中的 elimination 研究

这篇研究报道了猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）弱毒疫苗（MLV）重组毒株的 emergence 过程及其防控策略。研究团队在印第安纳州9248头规模的种猪场中，发现因误用两种PRRSV-2型弱毒疫苗（Prevacent? PRRS和Fostera? PRRS）导致重组毒株产生。通过全基因组测序（NGS）鉴定出两处重组断点（ORF1b-nsp9和ORF5区域），该重组毒株临床表现较温和，造成549头/千头母猪的断奶仔猪损失，经7周生物安全措施后成功 elimination。该研究为RNA病毒重组机制和疫苗使用规范提供了重要案例。

　　

引言
猪繁殖与呼吸综合征（PRRS）作为全球养猪业最具挑战性的疾病，其病原PRRSV是动脉炎病毒科的单股正链RNA病毒，通过RNA依赖RNA聚合酶（RDRP）机制复制，具有高突变率特性。研究背景追溯到1980年代末北美"神秘猪病"的报道，血清学证据显示该病毒早在1978年就已存在。PRRSV分为基因差异达40%的PRRSV-1和PRRSV-2两个物种，每年给美国养猪业造成12亿美元经济损失。

材料与方法
在印第安纳州9248头规模的种猪场中，后备母猪培育单元（GDU）原计划使用Prevacent PRRS（ORF5谱系1D.2）进行常规免疫，但工作人员错误地在7周龄仔猪群中额外接种了Fostera PRRS（谱系8C.1）。研究采用马尔可夫链蒙特卡洛算法构建指数加权移动平均（EWMA）模型，设置参数λ=0.4和3σ控制限，监测40周内的生产数据变化。通过MARC-145细胞培养进行病毒分离，采用MAFFT v7.450和RDP4软件进行重组分析。

结果
全基因组测序鉴定出15,363bp的重组毒株（GenBank PV607082），在nsp9（7616bp）和ORF5（13912bp）处存在重组断点。系统发育分析显示该毒株99.7%相似于Fostera PRRS，但ORF5区域98%相似于Prevacent PRRS。生产数据显示：断奶仔猪损失集中在11月11日至12月30日期间，EWMA模型检测到549头/千头母猪的损失峰值。生长育肥阶段死亡率仅短暂升高（3.85%→11.18%），GLIMMIX模型分析显示总体差异不显著（p=0.0103）。

讨论
该MLV重组毒株的临床表现显著弱于野毒株重组体（如L1C.5谱系毒株），其生产损失仅为典型野毒株爆发的15%，恢复期缩短15周。研究强调三点防控启示：避免在种猪群轮换使用不同MLV疫苗；对活病毒接种物（LVI）进行NGS检测；强化针头更换、禁止交叉寄养等生物安全措施。通过Swine Disease Reporting System数据库追踪发现，除2025年4月在爱荷华州检出1例相似毒株外，该重组毒株未形成区域性传播。

该研究首次系统报道了PRRSV疫苗株间重组的田间案例，其创新性体现在：建立EWMA模型量化生产损失；通过噬斑纯化技术验证重组稳定性；提出"金字塔式"疫苗使用策略——不同疫苗应在生产链下游使用。这些发现为RNA病毒进化研究和疫苗合理使用提供了重要范式。