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基于全基因组SNP标记的澳洲坚果DNA指纹图谱构建及其种质资源鉴定应用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月23日 来源:Horticulture, Environment, and Biotechnology 2.5
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为解决澳洲坚果种质资源鉴定效率低下的问题,来自多国的研究团队基于全基因组重测序数据,从1.24亿个SNP标记中筛选出284个核心标记,构建了187份种质资源的DNA指纹图谱并生成二维条形码。该研究为澳洲坚果种质资源认证和知识产权保护提供了精准可靠的分子身份证。
在热带亚热带地区广泛种植的澳洲坚果(Macadamia)作为重要经济果树,其种质资源鉴定长期受限于缺乏DNA指纹技术。一项跨国合作研究通过全基因组重测序(whole genome re-sequencing)技术,对来自美国、澳大利亚、南非、以色列和中国的187份种质资源进行分析,从惊人的1.24亿个单核苷酸多态性(SNP)标记中层层筛选,最终获得284个具有适度多态性的核心SNP标记集。
研究团队基于这些"分子身份证"标记,成功构建了覆盖全部样本的DNA指纹图谱系统。更巧妙的是,他们将每个种质的遗传信息编码成二维条形码,就像给每棵果树办了张独一无二的"基因身份证"。这项突破不仅解决了传统形态学鉴定周期长、准确性差的痛点,更为后续种质资源真伪鉴别、品种权保护等应用场景提供了强有力的分子工具。
值得注意的是,这套SNP指纹系统的核心标记经过严格筛选,既保证了足够的鉴别精度,又避免了过度复杂的检测流程。就像用284个精心挑选的基因密码片段,就能准确区分全球主要产区的澳洲坚果种质资源。该成果为果树种质资源管理提供了标准化、信息化的新范式,对推动坚果产业高质量发展具有重要意义。
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