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基于表面成像表型的转录组解码及其在药物转录组学中的应用研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月23日 来源:Nature Communications 14.7
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本研究通过整合高分辨率表面成像表型与空间密集的人类大脑转录组数据,开发了创新的转录组解码框架,成功解析了GABAA受体亚基的皮层表达模式与神经精神症状的关联。研究人员利用艾伦人脑图谱(AHBA)和正电子发射断层扫描(PET)数据,验证了5-HT受体基因表达与蛋白结合的对应关系,并首次将GABAA受体亚基分为具有不同功能特征的转录组类别。该研究为中枢神经系统药物开发提供了新的靶向策略,发表于《Nature Communications》。
神经精神疾病的治疗长期面临靶向性不足的挑战,尤其是GABAA受体(GABAAR)和5-羟色胺(5-HT)系统等关键神经递质通路的异质性表达模式尚未完全解析。传统方法难以将宏观影像特征与分子机制直接关联,而艾伦人脑图谱(AHBA)提供的空间转录组数据为解决这一问题带来了曙光。来自德国法兰克福大学医院儿童青少年精神病学系(Department of Child and Adolescent Psychiatry, University Hospital of the Goethe University)与英国伦敦国王学院(King's College London)的研究团队,通过开发表面成像表型的转录组解码技术,首次实现了高分辨率神经影像与全基因组表达谱的空间对齐,相关成果发表于《Nature Communications》。
研究采用三大关键技术:1)基于AHBA样本的空间插值生成41k顶点级基因表达图谱;2)利用空间自相关保留零模型(α-preserving null models)进行转录组解码;3)通过层次聚类将13个GABAAR亚基基因分为功能差异的共表达集群。研究对象包括279名7-31岁个体的皮层厚度(CT)数据及焦虑/抑郁量表评分。
5-HT系统的解码技术验证
比较线性混合效应模型(LME)、广义最小二乘法(GLS)和梯度解码三种方法时,发现5-HT1AR基因(HTR1A)表达与PET蛋白结合的关联最强(r=0.48),证实了方法的可靠性。梯度解码在敏感性与特异性间取得最佳平衡,可检测100-2000个显著基因(padj<0.001)。
GABAAR亚基的转录组分类
通过层次聚类将GABAAR亚基分为两类:Cluster 1(α2/α3/α5/β1-3/ε/γ1)在边缘系统高表达,与焦虑症状正相关;Cluster 2(α1/α4/β2/γ2-3/δ)呈全皮层分布。PET数据显示γ3亚基(GABRG3)与苯二氮?结合位点相关性最高(r=0.48, pperm.adj<0.005)。
影像表型与行为关联
178名Cluster 1关联个体表现出边缘系统CT增厚与焦虑评分升高(t(74)=2.52, padj=0.03),而101名Cluster 2关联个体未见此现象。成人组中,边缘系统CT变异可解释26%的焦虑变异(r=0.26, p<0.01)。
该研究建立了神经影像与转录组数据的桥梁,揭示GABAAR亚基的异质性表达模式与其功能分化的关联:α2亚型通过边缘系统调控情绪,而α1亚型可能介导广泛认知功能。这种转录组解码框架为精准医疗提供了新思路,例如针对特定亚基开发抗焦虑药物,或根据个体神经解剖特征预测药物反应。未来需在纵向治疗队列中验证该模型的临床转化价值。
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