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多重交叉置换扩增技术(MCDA)快速检测产毒艰难梭菌:一种潜力巨大的床旁检测方法
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月23日 来源:Microbiology Spectrum 3.7
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这篇研究开发了一种基于多重交叉置换扩增(MCDA)技术的快速检测方法,用于产毒艰难梭菌(toxigenic Clostridioides difficile)的床旁诊断。研究显示,MCDA具有与实时荧光定量PCR(real-time PCR)相当的灵敏度(93.1% vs 86.2%),但检测时间显著缩短(16.08±4.62分钟 vs 39.82±4.44分钟),且特异性(92.4%)和阴性预测值(NPV 98.8%)优于VIDAS毒素检测(CDAB)。该技术为资源有限地区的艰难梭菌感染(CDI)早期干预提供了高效解决方案。
产毒艰难梭菌(toxigenic Clostridioides difficile)是引发艰难梭菌感染(CDI)的主要病原体,其快速检测对临床早期干预至关重要。本研究开发了一种靶向tcdB基因的多重交叉置换扩增(MCDA)技术,通过与实时荧光定量PCR和VIDAS毒素检测(CDAB)对比,证实MCDA的检测限(LoD)低至12.5 fg/反应(相当于2.5个基因组拷贝),且无交叉反应。在201例临床粪便样本中,MCDA检出40例阳性,平均检测时间(16.08±4.62分钟)显著短于PCR(39.82±4.44分钟),同时展现出更高的特异性(92.4% vs 80.8%)和阳性预测值(PPV 67.5% vs 43.2%)。
MCDA技术的快速性(最快5.7分钟检出高浓度样本)、操作简便性及平衡的性能指标,使其特别适合资源有限地区的床旁检测(POCT)需求,甚至可用于潜在的自检场景。
艰难梭菌感染(CDI)是全球抗生素相关性腹泻的主要病因,其临床谱从无症状携带到致命性伪膜性肠炎不等。尽管医院获得性CDI病例减少,社区获得性感染(CA-CDI)比例上升,美国2017年约22.4万例感染中半数源于社区。现有诊断方法如细胞毒性中和试验(CCNA)和酶免疫分析(EIA)存在耗时长(CCNA需48小时)或灵敏度低(EIA仅60-85%)的缺陷。尽管实时荧光定量PCR灵敏度高,但依赖专业设备和人员,限制了其在床旁的应用。
研究团队针对tcdB基因(GenBank: KC292162.1)设计了4组MCDA引物,最终优选第2组(含10条引物),在63°C下实现高效扩增。临床样本来自2021年10月浙江省人民医院的腹泻患者粪便,通过Xpert C. difficile检测初筛后,采用MCDA、实时PCR、VIDAS CDAB和CCNA平行检测。
引物优化与特异性
引物组2在63°C下表现最佳,仅对6株产毒菌株(含ATCC BAA-1870)产生特异性扩增,非产毒菌株和27种腹泻相关病原体均为阴性。
灵敏度与速度
MCDA与实时PCR的LoD均为12.5 fg,但MCDA检测500 pg样本仅需5.7±0.5分钟,而实时PCR需23.97±0.3分钟;低浓度(12.5 fg)检测时间分别为21.35±2.2分钟和46.6±0.95分钟。
临床性能
以CCNA为金标准,MCDA的灵敏度(93.1%)显著高于VIDAS CDAB(34.5%),且阴性预测值(98.8%)优于VIDAS CDAB(90.1%)。尽管VIDAS CDAB特异性达100%,但其低灵敏度(34.5%)限制了临床应用。
MCDA通过10条引物靶向tcdB基因多个区域,其特异性优于传统PCR(仅用2引物1探针)。研究还发现,部分CCNA阴性样本被MCDA/PCR检出,可能因CCNA灵敏度不足导致假阴性。粪便中抑制剂(如胆汁酸)可能影响MCDA效率,未来需优化核酸提取流程。
该技术的单次检测成本约1.2美元,低于实时PCR(2.2美元),结合其便携性,尤其适合基层医疗机构。尽管MCDA无法区分CDI与无症状定植(CDC),但其高阴性预测值可有效排除非产毒菌株,减少不必要的抗生素治疗。
未来需开发集成横向流动试纸条的便携设备,并扩大临床验证以评估其在流行病学监测中的价值。
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