枯草芽孢杆菌ka15全基因组测序：源自非洲传统发酵调味品Kawal的优质发酵剂

来自布基纳法索约瑟夫·基-泽尔博大学和中国华中农业大学的研究团队，针对发酵剂潜在抗生素抗性基因问题，完成了枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)ka15菌株全基因组测序。该菌株分离自非洲传统发酵食品Kawal，基因组大小4,312,934 bp，含4,588个CDS及多种抗菌肽基因簇，未检出毒力因子和耐药基因，为安全发酵剂的开发提供重要分子依据。

　　

在非洲传统食品发酵领域，枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)被公认为优质发酵剂starter culture，其兼具抗菌、抗癌、抗氧化及维生素合成等特性。然而部分市售菌株携带抗生素抗性基因antibiotic resistance genes的隐患，促使科研人员对分离自乍得阿贝歇市场的传统发酵调味品Kawal（以钝叶决明Senna obtusifolia叶片为原料）的ka15菌株展开深入研究。

通过Illumina MiSeq平台进行2×250 bp双端测序，结合SPAdes软件完成基因组de novo组装，该菌株基因组呈现4,312,934 bp环形结构，GC含量43.5%，包含4,703个基因。经NCBI-PGAP注释及抗性基因筛查，发现82个tRNA、28个rRNA以及bacillilaene、subtilosin A等抗菌肽antimicrobial peptides合成基因簇，但未检出质粒和耐药基因。实验采用Promega基因组DNA提取试剂盒，OD₆₀₀值0.6时收获菌体，Trimmomatic软件进行原始数据质控，最终通过antiSMASH 7.0预测到surfactin、fengycin等次级代谢产物合成通路。

这项研究不仅揭示了ka15菌株作为安全发酵剂的基因组特征，其标准化测序流程（NCBI登录号OP798035.1）更为非洲传统发酵食品的工业化生产提供了分子水平的质量监控依据。研究获得法国文化合作行动处SCAC的经费支持，相关成果对发展中国家的食品微生物安全评估具有示范意义。