新型EG簇噬菌体Rowlf的分离与基因组注释：揭示紫色酸性磷酸酶样基因的独特进化

来自爱达荷州立大学的研究团队从校园草垫中分离出一株新型噬菌体Rowlf，该噬菌体具有典型的siphovirus形态特征，基因组测序显示其含有104个预测基因，其中包括一个在豆科植物中常见的紫色酸性磷酸酶(PAP)样基因。这项研究为噬菌体治疗和新型基因功能探索提供了重要资源。

　　

在爱达荷州波卡特洛市的草垫样本中，研究者成功分离出一株形态学鉴定为长尾噬菌体(siphovirus)的新型噬菌体Rowlf。该噬菌体展现出典型的噬菌斑特征：中等大小的晕轮伴牛眼状结构，透射电镜测量显示其头部直径57-58nm，尾部长度164-165nm。

基因组测序揭示Rowlf具有62,044bp的线性双链DNA，GC含量66.8%，与宿主Microbacterium foliorum NRRL B-24224的68.7%相近。通过高通量测序获得625,546条读长，覆盖深度达1,512倍。生物信息学分析鉴定出104个蛋白编码基因，其中40个获得功能注释。

特别引人注目的是gp26基因编码的蛋白与豆科植物紫色酸性磷酸酶(PAP)具有显著相似性（HHpred预测概率>99%）。这类基因通常参与活性氧防御，但在噬菌体中的功能仍属未知。系统发育分析将其归类为EG簇噬菌体，这是除EK簇外首个报道携带PAP样基因的噬菌体。

研究采用PYCa培养基进行噬菌体培养，通过三轮回纯化获得高滴度（>10¹⁰ pfu/mL）裂解液。DNA提取使用Promega Wizard试剂盒，建库采用NEBNext Ultra II FS方案。基因组注释整合了DNAmaster、Genemark、Glimmer等多款生物信息学工具，并通过Phamerator进行基因簇比较分析。