动物咬伤伤口中分离的Pasteurella oralis WCHPO000540基因组草图解析及其临床意义

来自中国的研究团队针对动物咬伤感染中常见的Pasteurella oralis病原体，完成了菌株WCHPO000540的基因组测序。该研究通过Illumina HiSeq X10平台获得2.39 Mb的基因组草图（N50 348kb，GC含量37.15%），揭示了与模式菌株CCM 7950T的高度相似性（ANI 98.25%），为临床精准诊疗提供了新的分子依据。

　　

在动物咬伤引发的复杂感染中，多微生物需氧-厌氧混合感染常涉及标准经验疗法难以覆盖的人兽共患病病原体。一项多中心调查显示，超过50%的宠物咬伤病例中可检出巴斯德菌属（Pasteurella spp.）。其中，革兰阴性球杆菌Pasteurella oralis（原称"B型菌"）作为哺乳动物口腔黏膜的定植菌，能引发严重软组织感染，但此前全球仅有两个基因组数据公开，严重制约了其分子机制研究。

华西医院团队从鼬科动物咬伤患者的伤口分泌物中分离出菌株WCHPO000540，通过哥伦比亚血琼脂培养和三区划线获得纯培养物。采用Illumina HiSeq X10平台完成测序（读长150bp，覆盖度381×），经Trimmomatic质控和SPAdes组装后，2.39 Mb的基因组草图显示出与模式菌株CCM 7950^T高度一致的GC含量（37.15% vs 37.32%）和基因数量（2,272 vs 2,347个）。值得注意的是，该菌株携带3个CRISPR阵列（模式菌为2个），且对β-内酰胺类、大环内酯类等7种抗生素保持敏感，这为临床抗感染方案制定提供了重要参考。

基因组注释通过NCBI原核基因组注释管道完成，检出58个RNA基因（含5S/16S/23S rRNA各1-2个）和50个tRNA。与现有基因组数据的比较分析显示，WCHPO000540在毒力因子分布和耐药基因组成上呈现独特特征，暗示巴斯德菌属可能存在宿主适应性进化。该研究不仅丰富了人兽共患病原体的基因组数据库，更为开发快速分子诊断靶点和优化抗菌策略奠定了基石。