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玻利维亚高原盐碱与淡水湖泊中蓝藻垫及其相关微生物组的多样性研究与生态功能解析
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月24日 来源:Frontiers in Microbiology 4.5
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这篇综述通过整合形态学分析、16S rRNA基因高通量测序(ASV)和系统发育重建,首次全面解析了玻利维亚高原极端环境(高海拔、强UV辐射、低降水)下蓝藻垫(Cyanobacterial mats)及其微生物组的多样性。研究鉴定出42个蓝藻属(含16个潜在新谱系),揭示了以Nostocaceae为主的7种形态型,并发现关联微生物组(Alphaproteobacteria/Bacteroidia等)主导的光合-化能异养代谢、硫呼吸及固氮功能,为极端环境微生物适应机制和生物技术应用(如生物修复)提供了新见解。
玻利维亚高原(Altiplano)作为地球极端环境的典型代表,具备高海拔(3,656-4,430 m)、强紫外线辐射、盐碱(pH>0.5%)与淡水(pH<0.5%)湖泊并存等特征。这类"多极端"(polyextreme)环境成为研究微生物适应性的天然实验室。蓝藻(Cyanobacteria)作为先锋物种,通过形成微生物垫(microbial mats)参与碳氮循环,但其多样性及生态功能仍待深入探索。
研究团队在2023年8月对高原8个湖泊(4盐碱/4淡水)进行采样,结合形态学(LEICA显微成像)和分子生物学分析。DNA提取采用DNeasy PowerSoil Pro Kit,通过Illumina NextSeq 2000平台对16S rRNA基因V3-V4区测序(引物338F/806R),数据存入ENA(PRJEB88730)。采用QIIME2和dada2进行ASV分析,SILVA 138-NR99数据库分类,并通过最大似然法(GTR+G+I模型)构建系统发育树。功能预测使用FAPROTAX软件。
显微观察发现7种形态型,以Nostocaceae为主(占57%序列)。例如Salar de Uyuni盐湖样本中,短密型(GBC221)与松散型(GBC222)Nostoc形态差异显著;淡水样本GBC224则发现类似Microcoleus的丝状形态(5-6 μm宽)。
16S rRNA分析揭示:
关联微生物组以Alphaproteobacteria(28%)、Bacteroidia(22%)、Gammaproteobacteria(18%)为主,核心功能包括:
研究首次证实:
该研究为极端环境微生物资源库的挖掘奠定了框架,未来需通过分离培养(如潜在新属Mojavia sp.)和宏基因组学进一步验证功能基因。
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