厄瓜多尔生乳中沙门氏菌(Salmonella spp.)高污染率研究：伤寒/副伤寒/肠炎/鼠伤寒血清型的分子鉴定及公共卫生风险

本研究通过qPCR和细菌分离技术，揭示厄瓜多尔皮钦查和马纳维省生乳中沙门氏菌(Salmonella spp.)污染率高达37.5%，其中鼠伤寒(S. Typhimurium)和肠炎(S. Enteritidis)为优势血清型。研究首次证实气候季节（暖季污染率96%）与生产规模（小农户81.8%）显著影响污染水平，为热带地区食源性疾病(FBD)防控提供关键数据。

　　

沙门氏菌在厄瓜多尔生乳中的流行特征

方法学创新与验证

研究团队采用ISO 6579-1:2017标准结合双重分子检测策略：基于ttr基因的qPCR（灵敏度达单拷贝）直接筛查600份生乳样本，同步通过XLD培养基分离菌株。标准曲线显示97.6%扩增效率，与细菌培养结果一致性达94.67%（Kappa=0.96）。血清型鉴定采用双重PCR体系，分别靶向伤寒/副伤寒（STY-1/SPA-2基因）和肠炎/鼠伤寒（prot6E/sdfI基因）的特异性标记。

流行病学关键发现

在225份阳性样本中，暖季（6-9月）污染率高达96%，显著高于雨季（p<0.001）。小农户样本阳性率（81.8%）超中型农场，皮钦查省污染率（55%）略高于马纳维省。血清型分布呈现"双峰模式"：肠炎（27.5%）与鼠伤寒（27.6%）占比最高，副伤寒（14.2%）和伤寒（12.4%）次之，19.1%菌株未能分型。值得注意的是，肠炎血清型在雨季仍保持活跃，2月检出率达峰值。

分子生物学证据

16S rDNA系统发育树（MEGA X构建）显示，10株测序菌株与NCBI数据库的伤寒沙门氏菌相似度>98%，形成独立于S. bongori的进化枝。未分型菌株的遗传距离提示可能存在都柏林(S. Dublin)或纽波特(S. Newport)等罕见血清型。

公共卫生启示

研究首次在生乳中检出人源专属的伤寒/副伤寒血清型，暗示加工环节的人为污染风险。非伤寒血清型的高流行（占阳性样本75.6%）与当地动物宿主（禽类/牲畜）携带状况相关。温度适应性实验数据支持暖季暴发机制：30°C时沙门氏菌代时缩短50%，与MSRV培养基40°C富集条件形成互证。

技术应用展望

现行ISO方法需48小时完成检测，而qPCR方案将周期压缩至5小时。作者建议将ttr-qPCR纳入AGROCALIDAD监管体系，并开发多重检测试剂盒同步识别4种高危血清型。针对小农户的干预措施应聚焦挤奶设备消毒（氯制剂耐受基因spvD在62%鼠伤寒菌株检出）和冷链运输改进（22°C以下储存可抑制93%菌株增殖）。

局限性说明

样本采集未覆盖厄瓜多尔全境（仅2个主产省），且未进行抗生素耐药性检测（已知CTX-M/KPC-2基因在南美流行）。16S测序分辨率不足导致部分菌株分类缺失，后续研究拟采用全基因组测序(WGS)解析ST型别。

政策建议

基于37.5%的污染基线数据，研究团队提出三级防控策略：1）强制 pasteurization（巴氏消毒）标识制度；2）暖季月度农场抽检（样本量≥384份/省）；3）建立沙门氏菌毒力基因数据库（含pSLT质粒/SPI-1岛标记）。这些措施可降低50%以上的食源性疾病负担，尤其保护婴幼儿/老年人等易感人群。