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基于LC-MS与GC-MS多组学整合分析揭示胶质瘤新型通路改变与生物标志物
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月25日 来源:Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis 3.1
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本研究首次整合LC-MS蛋白质组学、非靶向代谢组学和GC-MS代谢组学技术,系统分析了不同WHO分级的胶质瘤组织,揭示了线粒体功能障碍、代谢应激反应和细胞骨架重塑等关键通路改变,发现溶血磷脂酰胆碱(LPC P-18:0/O-18:0)等新型生物标志物,为胶质瘤精准诊疗提供新靶点。
胶质瘤作为中枢神经系统最常见的原发性肿瘤,其高度异质性和侵袭性特征一直是临床治疗的难点。尽管基因组学分类已显著提升诊断精度,但肿瘤进展过程中蛋白质和代谢物的功能变化仍如"黑箱"般未被完全揭示。传统研究多聚焦于单一组学层面,难以全面捕捉驱动肿瘤恶化的分子网络互作机制。尤其在不同WHO分级胶质瘤的跨级别转化过程中,哪些关键分子事件推动肿瘤从低级别向高级别演进?这个核心问题亟待多维度解析。
针对这一科学瓶颈,波兰比亚韦斯托克医科大学(Medical University of Bialystok)的研究团队在《Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis》发表突破性研究。他们开创性地将基于液相色谱-质谱(LC-MS)的TMT标记定量蛋白质组学、非靶向代谢组学与气相色谱-质谱(GC-MS)代谢组学技术进行整合,系统分析了涵盖所有WHO分级的胶质瘤组织样本。通过这种多组学"全景扫描"策略,首次绘制出胶质瘤跨级别演变的分子图谱。
关键技术方法包括:1)采用TMT标记的LC-MS技术对30例不同分级胶质瘤组织进行深度蛋白质组定量;2)结合非靶向LC-MS和GC-MS平台检测小分子代谢物;3)利用生物信息学整合分析蛋白-代谢物关联网络。所有样本均来自比亚韦斯托克大学医院生物样本库,经伦理委员会批准(APK.002.98.2021和APK.002.103.2022)。
【Integrative Multi-Omics Approach to Glioma Characterization】
研究团队通过跨平台数据整合,发现低级别向高级别胶质瘤转化时呈现显著的代谢重编程特征:糖酵解关键酶HK2和LDHA表达上调,伴随乳酸堆积;三羧酸循环(TCA cycle)中间产物减少,提示线粒体功能受损。尤为重要的是,首次检测到溶血磷脂酰胆碱plasmalogen亚型(LPC P-18:0和LPC O-18:0)的异常积累,这类具有抗氧化特性的膜磷脂可能成为新的分级标志物。
【Mitochondrial Dysfunction and Metabolic Stress】
蛋白质组数据揭示氧化磷酸化复合体亚基(如COX5B、NDUFS3)表达显著下调,与GC-MS检测到的TCA循环代谢物(α-酮戊二酸、琥珀酸)减少相互印证。同时发现转酮醇酶(TKT)和苹果酸酶1(ME1)等代谢酶的表达变化,表明磷酸戊糖途径和NADPH合成通路激活,为肿瘤应对氧化应激提供分子基础。
【Cytoskeletal Remodeling and Immune Modulation】
整合分析显示,高级别胶质瘤中波形蛋白(VIM)和胶质纤维酸性蛋白(GFAP)表达模式改变,提示细胞骨架重构与侵袭性增强相关。免疫相关蛋白如HLA-DR和补体成分显著下调,可能与肿瘤免疫逃逸机制有关。
这项研究通过多组学"交叉验证"策略,不仅证实了胶质瘤经典的Warburg效应,更发现plasmalogen代谢紊乱、TKT-ME1分子轴激活等新型调控机制。这些发现为理解胶质瘤恶性转化提供了三维视角:从能量代谢异常(糖酵解优势)、氧化防御(NADPH供应)到细胞结构重塑(细胞骨架动态),构成驱动肿瘤进展的"三位一体"机制。
特别值得关注的是,研究团队建立的LC-MS/GC-MS联合分析框架,为其他恶性肿瘤的多组学研究提供了技术范本。发现的LPC P-18:0等代谢物标志物,因其在脑脊液中可检测的特性,具有潜在的临床转化价值。该成果不仅深化了对胶质瘤分子病理的认识,更为开发分级诊断试剂盒和靶向代谢干预策略奠定了理论基础,标志着胶质瘤研究从基因组时代迈向多组学整合的新阶段。
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