AdeJ外排泵近端结合位点与F-loop突变介导抑制剂耐药机制解析

【字体: 时间:2025年07月25日 来源:Antimicrobial Agents and Chemotherapy 4.1

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  这篇研究深入解析了鲍曼不动杆菌(A. baumannii) AdeIJK外排泵关键组分AdeJ的耐药机制。通过构建PBP(近端结合位点)、F-loop(柔性环)及DBP(远端结合口袋)的特定位点突变体,发现E675A/R701A突变导致对双苯基类外排泵抑制剂(EPIs)特异性耐药,而F178C突变反而增强对萘基类EPIs的敏感性。研究创新性揭示了EPIs通过干扰AdeJ构象转换(access-binding-extrusion)发挥抑制作用,为针对RND超家族外排泵的靶向药物设计提供了新思路。

  

AdeJ外排泵的分子结构与功能特征
鲍曼不动杆菌作为革兰阴性条件致病菌,其临床分离株普遍存在AdeIJK三组分外排泵系统。该系统中,内膜转运蛋白AdeJ与周质适配蛋白AdeI、外膜通道AdeK协同工作,通过构象循环(access-binding-extrusion)将抗生素排出胞外。冷冻电镜结构显示AdeJ存在两个关键功能区:由F-loop(E675)和G-loop(F618)连接的近端结合位点(PBP),以及富含芳香族残基(F178/V139等)的远端结合口袋(DBP)。

突变体构建与表型分析
研究团队在AbΔ3(缺失adeIJK/adeAB/adeFGH)菌株中构建了9个AdeJ单点突变体,包括PBP区(N81A/R701A/G721I)、F-loop(E675A)、G-loop(F618A)和DBP区(F136A/F178C等)。Western blot证实所有突变体表达量差异在2倍以内。MIC测定显示:

  • F178C突变导致对SDS、EtBr和新生霉素(NOV)的广谱敏感性升高
  • E675A和G721I仅对SDS敏感性增加
  • F136A突变反而增强对四环素(TET)和氯霉素(CHL)的泵出能力

荧光探针动力学研究
通过实时监测EtBr(胞内DNA结合)和NPN(膜嵌入)的积累动力学发现:

  • F178C完全丧失对两种探针的泵出能力
  • E675A突变体对NPN的转运效率比野生型(WT)提高30%
  • 稳态浓度分析显示V139C/G721I对EtBr转运存在特异性缺陷

外排泵抑制剂的构效关系
测试8种4,6-二氨基喹啉类EPIs发现:

  • 双苯基类化合物24/29/30对E675A/R701A的MPC4值升高4-8倍(耐药)
  • 萘基类化合物2对F178C的MPC4降低8倍(增敏)
  • 苯甲酰基类12/17/22对所有突变体保持活性
    棋盘实验证实化合物30与F178C突变体存在显著协同效应(FICindex<0.5)

分子对接与机制解析
AutoDock Vina模拟显示:

  • 所有EPIs在DBP的结合分数最优(-13.2至-10.3 kcal/mol)
  • 化合物2的萘环与F616/F629形成π-π堆积,酚羟基与Y327氢键
  • 突变体与WT的对接分数差异<1 kcal/mol,提示耐药性源于动力学而非热力学因素
    特别值得注意的是,R701A突变会破坏R701-E723盐桥,导致PBP入口静电环境改变;而E675A则通过解除对F-loop的构象约束,加速双苯基类EPIs的转运。

临床转化价值
该研究首次揭示:

  1. AdeJ的F-loop不仅是底物通道的"导向轨",更是构象转换的"分子刹车"
  2. EPIs的抑制效率取决于其与PBP/DBP界面的动态相互作用
  3. 针对E675/R701的变构抑制剂可能克服现有EPIs的耐药问题
    这些发现为开发新一代外排泵抑制剂提供了明确靶点,对治疗碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌感染具有重要临床意义。
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