综述：DNA甲基化在细菌病原体致病性中的新兴作用

这篇综述系统阐述了DNA甲基化（5mC/4mC/6mA）如何通过调控抗生素耐药性（AMR）、毒力基因表达、生物膜形成等机制影响细菌致病性，揭示了甲基转移酶（MTases）如Dam、ModA等作为抗菌靶点的潜力，为感染性疾病防治提供了表观遗传学新视角。

　　

方法篇：DNA甲基化测序技术革新

随着第三代测序技术的发展，单分子实时测序（SMRT）通过聚合酶动力学检测6mA（高灵敏度）、4mC（中灵敏度）和5mC（低灵敏度），成为细菌甲基化研究的里程碑。而亚硫酸氢盐测序（BS-seq）仍是5mC检测的"金标准"，但其DNA降解缺陷被超快速亚硫酸氢盐测序（UBS-Seq）通过铵盐替代所优化。新兴的酶转化测序（EM-seq）和纳米孔测序则分别通过APOBEC3A酶解和电流波动检测，实现了无损伤甲基化分析和长读长检测。这些技术为解析细菌表观基因组提供了多维度工具。

耐药调控：甲基化与抗菌药物博弈

甲基转移酶通过独特机制调控耐药性：在嗜水气单胞菌中，AveC4I甲基化趋化调节基因^cheY/cheB；淋球菌ModA13失活会上调膜蛋白MtrF，导致Triton X-100耐药；而大肠杆菌Dam与^recA协同缺失可显著增强β-内酰胺类敏感性。更引人注目的是，结核分枝杆菌HsdM通过调控^trcR mRNA降低异烟肼敏感性，揭示甲基化网络在耐药进化中的核心地位。

毒力开关：甲基化操纵致病基因

甲基化精准调控毒力因子表达：化脓链球菌SpyMEW123I通过6mA修饰激活毒力调控蛋白Mga；沙门氏菌Dam缺失会损害SPI-1效应蛋白（SipA-C）分泌，并经由HilD转录因子下调毒力岛表达。在问号钩端螺旋体中，保守甲基化酶LomA通过胞外功能σ因子调控毒性，而金氏菌ModK1则通过抑制IL-8释放实现免疫逃逸。这些发现揭示了甲基化作为"分子开关"调控病原体侵袭力的精确机制。

生存策略：生物膜与运动性调控

甲基化动态调控病原体适应性结构：沙门氏菌Dam通过RcsB/PmrA系统调控脂多糖O抗原链长度，影响生物膜形成；幽门螺杆菌M2.HpyAII甲基化TCTTC序列降低LPS合成，而HpyAVIBM突变会激活^fliR等鞭毛基因。更巧妙的是，铜绿假单胞菌^hsdMSR系统通过sRNA ^prrF1调控铁代谢，助力其在氧化应激中存活。

环境适应：甲基化驱动的进化优势

病原体通过甲基化实现环境响应：在牙龈卟啉单胞菌中，Dam/Dcm调控血红素依赖的毒力决定簇；艰难梭菌CamA通过CAAAAA位点甲基化调控σ因子，影响孢子形成效率。结核分枝杆菌MamA则通过σ因子结合位点甲基化，优化缺氧适应基因表达。这些机制展现了甲基化作为"环境传感器"的进化价值。

展望：表观遗传治疗的未来

尽管细菌缺乏组蛋白修饰，但DNA甲基化构成了其表观调控核心。挑战在于：1）开发高精度4mC/6mA检测技术；2）解析关键甲基化位点的时空动态；3）探索去甲基化酶的作用。甲基转移酶抑制剂与甲基化生物标志物的联合应用，或将为抗感染治疗开辟新纪元。